原文:Meta-analysis of GWAS | 原理 | 實例

TOC Meta analysis是什么 常用的工具有哪些 深入Meta analysis的統計學原理 Meta analysis實例,輸入輸出分別是什么 Meta analysis注意事項,模型選擇 關於Meta的在不同場景下的意思 Meta analysis是什么 常用的工具有哪些 就是整合分析,大概是借鑒了醫學里的meta分析,將不同的GWAS整合到一起,可以是同一個trait,也可以是幾個 ...

2020-07-24 02:28 0 1165 推薦指數:

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GWAMA:gwas meta-analysis工具

下載和安裝 從官網(https://genomics.ut.ee/en/tools/gwama-download)上下載或: wget http:/www.geenivaramu.ee ...

Wed Nov 04 05:04:00 CST 2020 0 377
GWAS條件分析(conditional analysis

一、為什么要做GWAS的條件分析(conditional analysis) 我們做GWAS的時候,經常掃出一堆顯著的信號,假設rs121是我們掃出來與某表型最顯著相關的位點(P=1.351e-36),rs124尾隨其后(6.673e-22),也是與該表型顯著相關,那么這個時候,我們就有問題 ...

Thu Jan 17 03:20:00 CST 2019 0 1302
一行命令學會全基因組關聯分析(GWAS)的meta分析

為什么需要做meta分析 群體分層是GWAS研究中一個比較常見的假陽性來源. 也就是說,如果數據存在群體分層,卻不加以控制,那么很容易得到一堆假陽性位點。 當群體出現分層時,常規手段就是將分層的群體獨立分析,最后再做meta分析。 1.如何判斷群體是否分層 先用plink計算PCA ...

Fri May 24 00:09:00 CST 2019 0 1472
全基因組關聯分析(GWAS)的計算原理

前言 關於全基因組關聯分析(GWAS原理的資料,網上有很多。 這也是我寫了這么多GWAS的軟件教程,卻從來沒有寫過GWAS計算原理的原因。 恰巧之前微博上某位小可愛提問能否寫一下GWAS的計算原理。我一順口就答應了。 后面一直很懶,不願意動筆,但想着既然答應了,不寫說不過去。 我寫 ...

Wed Oct 23 02:49:00 CST 2019 0 1269
Latent Semantic Analysis(LSA/ LSI)原理簡介

LSA的工作原理: How Latent Semantic Analysis Works LSA被廣泛用於文獻檢索,文本分類,垃圾郵件過濾,語言識別,模式檢索以及文章評估自動化等場景。 LSA其中一個目的是解決如通過搜索詞/關鍵詞(search words)定位出相關文章。如何通過對比單詞 ...

Tue Sep 04 01:46:00 CST 2018 0 1352
 
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