原文:BSA分析

目錄 兩種算法 . 歐氏距離 ED 算法 . SNP index算法 實操 . 上游分析 . 下游分析 兩種算法 . 歐氏距離 ED 算法 mut與wt分別代表突變型混池 野生型混池,A C G T表示標記位點各突變型所占測序reads的比例,對於二倍體來說,大部分標記只有兩種突變型。 MMAPPR,ED法是其中一個環節,通過計算不同混池間各突變型的頻率距離,采用距離差異來反映標記與目標區域的連 ...

2020-05-13 15:38 0 1509 推薦指數:

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BSA混合分離分析

BSA(Bulked Segregant Analysis)又稱混合群體分離分析法,是利用極端性狀進行功能基因挖掘的一種方法。主要思想是將兩個具有極端性狀的群體進行混池測序,比較兩個群體在多態位點(SNP)的Allele Frequency(AF)是否具有顯著差異。以植物株高性狀為例,收集株高處 ...

Thu Dec 31 00:15:00 CST 2015 0 2948
分析


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Thu Nov 05 01:37:00 CST 2015 14 93
勢能分析(splay分析

定義 第$x$次操作后,勢能為$\phi(x)$,該操作實際復雜度$c(x)$,均攤復雜度$a(x)$。 定義$a(x)=c(x)+\phi(x)-\phi(x-1)$。 那么總復雜度為$\ph ...

Mon May 27 00:02:00 CST 2019 0 577
采購分析&庫存分析

采購分析 原材料采購是企業生產的基礎,采購物品的價格以及質量問題直接影響到產品的質量與成本。一個好的全面的采購分析對於制定下一步采購策略是至關重要的。基於數據倉庫技術的商業智能系統可實現供應商信用評價、業務員業績考核等決策分析,幫助企業為順利生產打下堅實的基礎,為最終產品在質量和成本上的定位提供 ...

Tue Oct 13 00:26:00 CST 2020 0 631
二、硬件分析-電路分析

前言   本節介紹一些有關電路和電路分析的一些基本知識和工具。 電路的定義   由金屬導線和電氣、電子部件組成的導電回路,稱為電路。在電路輸入端加上電源使輸入端產生電勢差,電路連通時即可工作。電流的存在可以通過一些儀器測試出來,如電壓表或電流表偏轉、燈泡發光等;按照流過的電流性質,一般 ...

Thu Feb 14 21:17:00 CST 2019 0 662
數值分析-誤差分析

方法誤差與舍入誤差 方法誤差   在用數學模型去預測某個值的時候,由於選取的數學模型產生的誤差   例如使用泰勒展開式求取近似f(x)時,其對應的拉格朗日余項即為方法誤差 舍入誤差   計 ...

Tue Oct 09 06:16:00 CST 2018 0 754
相關分析和回歸分析

相關分析 相關分析定義 相關分析(correlation analysis),相關分析是研究現象之間是否存在某種依存關系,並對詳細有依存關系的現象探討其相關方向以及相關程度,是研究隨機變量之間的相關關系的一種統計方法。 相關關系是一種非確定性的關系,比如,以X和Y分別記一個人 ...

Fri Apr 03 04:26:00 CST 2015 0 12581
lncRNA分析

目前人們對lncRNA認識還處在初級階段,lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉錄的副產物,不具有生物學功能。然而大量研究表明,lncRNA在細胞核內、核外,通過染色 ...

Fri Jul 10 01:30:00 CST 2020 0 973
 
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