SNP 過濾（一）
通用過濾 Vcftools（http://vcftools.sourceforge.net） 對vcf文件進行過濾 第一步：過濾最低質量低於30，次等位基因深度（minor allele count）不少於3 第二步：上述結果文件 ...
原文：SNP 過濾（二）
本文轉載於https: www.jianshu.com p e d dd c e SNP位點過濾 SNP過濾有兩種情況，一種是僅根據位點質量信息 測序深度，回帖質量等 對SNP進行粗過濾。如果使用GATK對重測序結果進行SNP calling，那么可以考慮下面的標准 QD lt . FS gt . MQ lt . MQRankSum lt . ReadPosRankSum lt . QUAL lt ...
2020-04-26 08:41 0 1888 推薦指數：
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