NCBI下載SRA數據
從NCBI下載數據本來是一件很簡單的事情，但是今天碰到幾個坑： 1、paper里沒有提供SRA數據號、也沒有提供路徑； 2、不知道文件在ftp的地址，不能直接用wget下載 所以通過在NCBI官網，直接在SRA搜索欄里： 輸入paper的title關鍵詞NIFTY BGI ...
原文：使用sratoolkit下載NCBI數據
如何使用sratoolkit下載NCBI數據 比如我想下載這個研究的數據， 使用prefetch命令，輸入對應的SRA號碼 prefetch SRR 默認下載限制是 G的數據，如果下載的數據較大，可以修改配置，比如改為最大 G prefetch max size G SRR 如何修改默認配置，特別是下載數據的存放位置 vdb config i 進入這個界面，需要按照指示操控鍵盤進行修改 如果上面這 ...
2020-04-09 13:56 0 1420 推薦指數：
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主要參考這篇文章： http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA5NjU5NjQ4MA==&mid=2651154488&idx=1&sn=e693 ...
NCBI SRA數據庫使用詳解
/48272598_749456477.shtml 我的下載的數據在/home/username/ncbi/public/s ...
7、sraToolkit安裝使用
參考：http://blog.csdn.net/Cs_mary/article/details/78378552 ###prefetch 參數解釋 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK158900 ...