原文:多序列比對&建樹

目錄 目標物種和序列 相關Seq列表 多序列比對的原理和方法 相關的工具 建樹的幾種方法 實際操作 Muscle amp ClustalW 可視化結果 newick文本 MEGAX本地 構建流程 距離矩陣和自帶建樹 手動建樹結果 關於NEWICK格式 相關鏈接 http: journals.sagepub.com doi . MR 冠狀病毒的Minireview http: www.biotra ...

2020-04-06 01:05 0 669 推薦指數:

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序列比對

文章轉載於 Original 2017-07-11 liuhui 生信百科 多序列比對(或多序列聯配,multiple sequence alignment,MSA),是指把多條(3 條或以上)有系統進化關系的蛋白質或核酸序列進行比對,盡可能地把相同的鹼基或氨基酸殘基排在同一 ...

Sun Jul 16 05:43:00 CST 2017 0 1903
Mega-序列比對

Aligning Sequences In this tutorial, we will show how to create a multiple sequence alignm ...

Thu Mar 05 21:09:00 CST 2020 0 2365
用blastall進行序列比對

用blastall進行序列比對 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常強大,其下面有非常多的參數,但是一般使用的參數如:-p、-i、-d、-o、-e等幾個。 -p: 執行的程序名稱 -d: 搜索的數據庫名稱 -i : 要查詢的序列文件名(Query File ...

Fri Mar 06 18:38:00 CST 2020 0 698
序列比對-muscle & trimal

2021年了,從零開始幾個字可以去掉了,做了很多次服務器搭建,其實能夠叫零的之前已經是講完了。 其實應該做一個總結,但是沒有時間,后面再說吧。 本文也沒有什么內容,因為很簡單: ...

Fri Jan 29 03:09:00 CST 2021 0 580
序列比對那點事兒

序列比對那點事兒 2012-04-17 ~ ADMIN 本來這應該是一本書,那樣的話的確需要花一點心思,就寫成一篇短文吧。 從字符比對開始說起吧。第一個問題最簡單,如何判斷兩個字符串是相等的。 int strcmp(const ...

Fri Oct 19 05:50:00 CST 2018 0 1405
MAFFT 進行多序列比對

簡介 最經典和廣為熟知的多序列比對軟件是 clustalw 。 但是現有的多序列比對軟件較多,有文獻報道:比對速度(Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee),比對准確性(MAFFT>Muscle>T-Coffee> ...

Mon Dec 30 03:01:00 CST 2019 0 2962
megacc的進行多序列比對

1.軟件的安裝: 網站:http://www.megasoftware.net/ windows上安裝,下載windows-command line(cc)版本的,格式為zip,解壓之后,里面有兩 ...

Fri Dec 22 03:59:00 CST 2017 0 1842
多重序列比對 CLUSTALX

【實驗目的】 1、熟悉構建分子系統發生樹的基本過程,獲得使用不同建樹方法、建樹材料和建樹參數對建樹結果影響的正確認識; 2、掌握使用Clustalx進行序列多重比對的操作方法; 3、掌握使用Phylip軟件構建系統發生樹的操作方法。 【實驗原理】 在現代分子進化研究中,根據現有生物基因 ...

Sat Oct 19 05:15:00 CST 2013 0 4737
 
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