【宏蛋白組】iMetaLab平台分析腸道宏蛋白質組數據
目錄 一、iMetaLab簡介 二、內置工具與模塊 1. Data Processing module 2. Functional Analysis 3. R Developing environment 4. R based ...
原文：【宏蛋白質組】搜庫工具簡介與評估
宏蛋白質組數據分析相對較難，不同於常規蛋白質組分析，因為數據庫太大，無法直接進行搜庫匹配，需要對數據庫進行優化。整理了幾個發表的宏蛋白搜庫分析工具。具體效果如何，還需要測試。 .ProteoStorm 發表：ProteoStorm: An Ultrafast Metaproteomics Database Search Framework Github：https: github.com miin ...
2020-03-19 23:00 0 1015 推薦指數：
相關推薦
【4】蛋白質組學鑒定軟件之MSGFPlus
目錄 1.簡介 2.安裝運行 3.結果 1.簡介 MSGF+也是近年來應用得比較多的蛋白鑒定軟件。java寫的，2008年初次發表JPR，2014年升級發表NC，免費開源，持續更新維護，良心軟件。而且，有研究者對不同蛋白質組學鑒定軟件進行比較分析 ...
蛋白質組學實驗設計、質控與分析
1. 實驗設計與技術路線 (1) 常用流程 流程 說明 1.材料收集 細胞、細胞上清、組織、血漿、血清、腦脊液、外泌體、尿液...... 2.定量技術 蛋白組：iTRAQ/TMT ...
Diamond軟件比對蛋白質數據庫
參考文章http://www.biotrainee.com/thread-1465-1-1.html http://blog.sina.com.cn/s/blog_83f77c940102vny ...
【5】蛋白質組學鑒定定量軟件之PD
目錄 1.簡介 2.安裝與配置 3.分析流程 4.結果 1.簡介 PD全稱Proteome Discoverer，是ThermoFisher在2008年推出的商業Windows軟件，沒錯，收費，還不菲。而且主要也是針對他們家的obitrap產出數據 ...
【6】蛋白質組學鑒定定量軟件之MaxQuant
目錄 1.簡介 2.下載安裝 3.配置與運行 4.結果 5.Perseus后處理 6.小結 1.簡介 2016年，德國馬普所的Cox和蛋白質組學領域巨擘Matthias Mann合作開發了MaxQuant軟件（MQ），並發表在nbt ...
蛋白質組學數據的缺失值填充
缺失值填充在數據分析領域的預處理過程繞不過去的一個坎，蛋白質組學也不例外，簡單記錄下，可能有些地方有其特殊之處。 分析缺失值來源：完全隨機缺失（MCAR，如質譜儀抖動，對數據影響無偏好性，均一分布），隨機缺失（MAR，依賴於其他觀測變量，如時間梯度越長采集越可能出現缺失值），非隨機缺失 ...
蛋白質組學數據分析——（1）原理
當前，關於高通量蛋白質組學的研究遠不如NGS這般火熱，網上關於這方面的知識也寥寥無幾，從事這一行也有一段時間了，但還沒好好總結過。加之過段時間可能要去做培訓，所以是時候把知識點總結一下，權當復習。當然整個蛋白質組學研究也算紛繁復雜，不可能面面俱到，而且很多東西我也在學習當中，肯定會出現不少紕漏 ...