本來是不會再寫這個文檔的,但是由於長時間沒有用這個模塊,這個模塊不知道是我自己弄掉了,還是別的同學誤刪了,於是我重新安裝一下。 首先下載conda,並下載好python which pip 直接安裝 注意: 1. 請下載conda3版本,本模塊 ...
最近發現了python版的MCScan,是個大寶藏。由於走了不少彎路,終於畫出美圖,趕緊記錄下來。 github地址https: github.com tanghaibao jcvi wiki MCscan Python version 軟件安裝 輸入數據 gff文件轉bed格式 獲取cds pep序列 小知識:也可以根據gff文件,基因組ref.fa文件中直接調取cds,和pep序列 共線性分析 ...
2020-03-19 16:57 0 3370 推薦指數:
本來是不會再寫這個文檔的,但是由於長時間沒有用這個模塊,這個模塊不知道是我自己弄掉了,還是別的同學誤刪了,於是我重新安裝一下。 首先下載conda,並下載好python which pip 直接安裝 注意: 1. 請下載conda3版本,本模塊 ...
比較基因組學中,共線性的分析的圖無疑是最漂亮的。 共線性分析可以很好地解釋進化關系和多倍化事件。 本文主要介紹的是唐老師的Python版McScan(jcvi工具包),這個包很強大,但是其功能在官網的說明並不詳細,在眾人的博客中也比較零散。 我剛使用這個包的時候(2017年)還很難安裝,需要 ...
1、保存圖片。 一、創建畫布 1、創建畫布和坐標軸 在Matplotlib中,plt.figure類可以看做一個能夠容納各種坐標軸、圖形、文字和標簽的容器。plt.Axes類是一個 ...
各位工程師累了嗎? 推薦一篇可以讓你技術能力達到出神入化的網站"持久男" 1.二維繪圖 a. 一維數據集 用 Numpy ndarray 作為數據傳入 ply 1. 2.操縱坐標軸和增加網格及標簽的函數 3.plt.xlim 和 plt.ylim 設置每個坐標軸 ...
經過幾輪調試和修改,共線性圖終於可以上眼了。如下: 圖中紅色的為目標基因,藍色的為reference species目標基因周圍15個基因,天藍色為再往外15個基因,黃色為與refere ...
1. 基本功能介紹 在海龜作圖中,我們可以編寫指令讓一個虛擬的(想象中的)海龜在屏幕上來回移動。這個海龜帶着一只鋼筆,我們可以讓海龜無論移動到哪都使用這只鋼筆來繪制線條。通過編寫代碼,以各種很酷的模 ...
一、關於Turtle “turtle是一個簡單的繪圖工具。它提供了一個海龜,你可以把它理解為一個機器人,只聽得懂有限的指令” 操縱海龜繪圖有着許多的命令,這些命令可以划分為兩種:一種為運動命令,一種為畫筆控制命令。 二、運動命令 forward(degree ...
轉載自網絡,版權歸原作者所有 hello3.txt文件內部數據如下 。。。。。。7,2,6,-12,-10,-7,-1,2,9,。。。。。。 python腳本 結果 ...