經過幾輪調試和修改,共線性圖終於可以上眼了。如下:
圖中紅色的為目標基因,藍色的為reference species目標基因周圍15個基因,天藍色為再往外15個基因,黃色為與reference species存在的共線性,灰色為相鄰物種間的共線性。
標注有物種信息,scaffold信息,並用顏色加以區分物種的不同屬性。
最后一章的代碼和思路更新見公眾號。
接下來公眾號將繼續更新R畫圖和文獻等內容。
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圖中紅色的為目標基因,藍色的為reference species目標基因周圍15個基因,天藍色為再往外15個基因,黃色為與reference species存在的共線性,灰色為相鄰物種間的共線性。
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