根據拿到的表達矩陣設為exprSet 用scale 進行標准化 數據中心化：數據集中的各個數字減去數據集的均值 數據標准化：中心化之后的數據在除以數據集的標准差。 在R中利用scale方法來對數據進行中心化和標准化 並不是表達矩陣里面的所有基因都可以進行相關性分析，首先去除reads count gt 小於 個的基因 測試樣品共有 個 另一種標准化 hclust 聚類分析 歐式距離 Euclide ...
2020-02-05 20:58 0 2174 推薦指數：
無生物學重復RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expression data without biological replicates BMC Bioinformatics 的一篇文章中提出了一種新 ...
尹師妹：“哈師兄，做驗證實驗好辛苦，老板讓我提高篩選差異基因的條件，盡量降低假陽性，我該怎么篩？” 小哈打開Evernote，給尹師妹看張表： “瞧見那個100%了嗎？30 million mapped reads的情況下，10次重復，2倍篩選條件，Statistical ...
來源https://baike.baidu.com/item/%E6%A3%80%E7%B4%A2%E8%A1%A8 定距式 這種形式也叫退格式檢索表。在編排時每兩個相對應的分支的開頭，都編在離左端同 ...
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 隨着ome為詞尾的各種組學的出現，轉錄組學已經成為了人們了解生物信息的一個重要組成部分。人們使用了許多辦法來掌握轉錄組的情況，主要分為兩類，一類是基於雜交，一類是基於下一代測序技術 ...
簡單理解RNA-seq 劉小澤 已關注 2018.10.17 23:51* 字數 1518 閱讀 46評論 0喜歡 3 今天就當一個小故事看吧，看了statQuest，感覺講的很棒，於是分享給大家原版視頻后台回復 ...
轉錄組測序中生物學重復如何來設 1.區分生物學重復與技術重復 生物學重復：指樣本重復，比如3只小鼠，同時做一種處理，就是三個生物學重復。 技術重復：一般是三次實驗，比如對一塊組織，提了三次RNA，做三次real time。 2.設置生物學 ...
冷凍電鏡 為什么冷凍電鏡 (Cryo-EM) 技術的發明可以獲得2017諾貝爾化學獎？知乎看法 Press release: The Nobel Prize in Chemistry 2017 ...
這部分開始進行基本的富集分析，兩類 A：差異基因富集分析（不需要表達值，只需要gene name） B: 基因集(gene set)富集分析（不管有無差異， ...
