原文:haploPS、XP-EHH、 Fst檢測正向選擇信號的實例介紹

歡迎來到 bio生物信息 的世界 下面是一篇文獻介紹。 關於人類基因組正向選擇信號的檢測分析。 .正向選擇的概念 正向選擇:某一突變位點逐漸積累,成為優勢的位點。 具體表現為:隨着時間延長,該位點的突變基因型頻率越來越高,遠遠超過野生型 .正向選擇的目的 通過比較馴化 野生動植物 現代智人 靈長類動物 特定人群 參考人群等方式,查找受到正向選擇的基因組。 解釋受到正向選擇的基因組與特定表型的關系。 ...

2020-01-03 18:59 0 1793 推薦指數:

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使用XP-CLR檢測基因組中的選擇信號

檢測基因組選擇信號的方法有很多種,其中 XP-CLR 方法是常用的一種。XP-CLR 是陳華老師、Nick Patterson 和 David Reich 在 2010 年發表的方法,全稱叫 the cross-population composite likelihood ratio test ...

Sun Jun 14 03:48:00 CST 2020 3 1667
使用Python版XP-CLR檢測基因組中的選擇信號

上一篇文章 《使用XP-CLR檢測基因組中的選擇信號介紹XP-CLR。XP-CLR 是一種是基於選擇掃盪(selective sweeep)的似然方法。選擇掃盪可以增加群體之間的遺傳分化,導致等位基因頻率偏離中性條件下的預期值。XP-CLR 利用了兩個群體之間的多基因座等位基因頻率差異 ...

Sun Jun 14 03:50:00 CST 2020 0 598
kail入侵xp實例

Kali的IP地址是192.168.0.112 Windows XP的IP地址是192.168.0.108 本文演示怎么使用Metasploit入侵windows xp sp3。 啟動msfconsole: # msfconsole 選擇一個漏洞 ...

Thu Jul 02 06:51:00 CST 2020 0 516
Nginx 相關介紹正向代理和反向代理)

參考來源:Nginx 相關介紹(Nginx是什么?能干嘛?) Nginx的產生   沒有聽過Nginx?那么一定聽過它的"同行"Apache吧!Nginx同Apache一樣都是一種WEB服務器,基於REST架構風格,以統一資源描述符(Uniform Resources Identifier ...

Tue Jan 11 02:17:00 CST 2022 1 741
linux信號介紹

1.基本概念 中斷:   中斷是系統對於異步事件的響應   中斷信號   中斷源   現場信息   中斷處理程序   中斷向量表 異步事件的響應:進程執行代碼的過程中可以隨時被打 ...

Mon Nov 28 23:26:00 CST 2016 1 2113
Fst計算

在群體遺傳學中衡量群體間的遺傳分化的程度的指標有許多種,較為常見的就是遺傳分化指數(Fst),fst是由F統計量演變而來,F統計量主要有三種(FIS,FIF,FST)。Fst是針對一對等位基因,如果基因座上存在復等位基因,則需要用Gst衡量,基因差異分化系數(gene ...

Sat Apr 10 01:53:00 CST 2021 0 502
Linux常見信號介紹

1、信號 首先信號我們要和信號量區分開來,雖然兩者都是操作系統進程通信的方式。可以簡單的理解,信號是用來通知進程發生了什么需要做什么,信號量一般是用作進程同步(pv操作) 2、常見信號量 (以下數字標號代表信號再bitmap中的位置) 2SIGINT 可能使我們最常用的信號之一。一般 ...

Sat Jun 26 18:44:00 CST 2021 0 295
 
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