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下面是一篇文獻介紹。
關於人類基因組正向選擇信號的檢測分析。
1.正向選擇的概念
正向選擇：某一突變位點逐漸積累，成為優勢的位點。
具體表現為：隨着時間延長，該位點的突變基因型頻率越來越高，遠遠超過野生型；
2.正向選擇的目的
通過比較馴化/野生動植物、現代智人/靈長類動物、特定人群/參考人群等方式，查找受到正向選擇的基因組。
解釋受到正向選擇的基因組與特定表型的關系。
3.正向選擇的方法
檢測正向選擇的方法有很多，下面以一篇文獻為例，為大家介紹怎么圍繞正向選擇講故事。
文獻來源“Detecting signatures of positive selection associated with musical aptitude in the human genome”
研究樣本：283個沒有親緣關系的芬蘭人。
研究表型：將這283個樣本按照音樂能力分為兩部分，case是音樂才能比較高的人，control是沒什么音樂天賦的。
基因型：Illumina HumanOmniExpress 12 1.0 V SNP chip
正向選擇分析方法：這里用了haploPS、XP-EHH、 Fst這三個方法掃描正向選擇位點。
2.1 haploPS方法
在case樣本中P值小於0.05的基因組區域，且在control樣本中，這些顯著基因組區域沒有達到顯著水平。
2.2 XP-EHH方法
XP-EHH得分達到top 0.1%的位點作為正向選擇的位點。
2.3 Fst方法
Fst值在top 1%的位點作為正向選擇的位點。
4. 將haploPS、XP-EHH、 Fst掃描到正向選擇位點以及基因進行生物學功能注釋
生物學功能注釋采用的Genetrail2工具（http://genetrail2.bioinf.uni-sb.de/）。
生物學功能注釋結果顯示，正向選擇的位點和基因 (DICER1, FGF20, CUX1, SPARC, KIF3A, TGFB3, LGR5, GPR98, PAX8, COL11A1, USH2A, and PROX1) 主要與內耳發育過程有關。
以上就是結合多個自然選擇的工具，闡述正向選擇的基因與表型之間的關系。
當然，不同文獻對這些自然選擇工具的閾值設定會有一點差別。
今天的文獻解讀就講到這。
所謂借鑒別人的文獻，做自己的分析。
希望各位讀者有所收獲!