GWAS: 曼哈頓圖，QQ plot 圖，膨脹系數（ manhattan、Genomic Inflation Factor）
畫曼哈頓圖和QQ plot 首推R包“qqman”，簡約方便。下面具體介紹以下。 一、畫曼哈頓圖 install.packages("qqman") library(qqman) 1、准備包含SNP, CHR, BP, P的文件gwasResults ...
原文：如何畫出高級感的曼哈頓圖，Manhattan++工具介紹
歡迎來到 bio生物信息 的世界 BMC Bioinformatics前幾天發布了一個畫曼哈頓圖的工具Manhattan , 這個名字很好理解，Manhattan的升級版。 這個工具與之前畫曼哈頓圖的工具有什么區別呢。 最大的特點是能將顯著的位點以及注釋信息顯示在曼哈頓圖上。 可視化很漂亮，特別有高級感。 好了，以下進入主題，講講怎么畫這個圖。 准備需要的輸入文件 需要的輸入文件有三個，分別是in ...
2019-12-01 16:10 0 668 推薦指數：
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