RNA-seq 數據的簡單分析
主要介紹如何分析RNA-seq 數據 參考文檔 Wikipedia-RNA-seq paper: RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics TopHat Cufflinks CummeRbund TopHat ...
原文：RNA-seq表達數據之樣本PCA分析
Principal component analysis PCA 分析 主成分分析 PCA 幫助我們歸納總結和可視化數據集中的信息，這些數據包含由多個相互關聯的變量描述的個體 觀察主成分分析。 可以將每個變量視為不同的維度。 但如果您的數據集中有 個以上的變量，那么很難在多維超空間可視化。 主成分分析是用來從一個多變量數據表中提取重要信息，並將這些信息表示為一組稱為主成分的新變量。 這些新的變量相 ...
2019-11-26 19:24 0 1509 推薦指數：
相關推薦
A survey of best practices for RNA-seq data analysis RNA-seq數據分析指南
A survey of best practices for RNA-seq data analysis RNA-seq數據分析指南 內容 前言 各位同學/老師，大家好，現在由我給大家講講我的文獻閱讀報告！ A survey of best practices ...
ChIP-seq | ATAC-seq | RNA-seq | 數據分析流程
補充RNA-seq流程 以前都是自己搭RNA-seq流程，雖然可以完成任務，但是數據量一多，批次多起來，就非常難管理。 既然別人提供了這么好的流程，那就要用起來，管理起來不是一般的輕松。 ENCODE-DCC/rna-seq-pipeline 安裝比較麻煩，沒有針對local的一鍵安裝 ...
RNA-seq(9):功能富集分析
這部分開始進行基本的富集分析，兩類 A：差異基因富集分析（不需要表達值，只需要gene name） B: 基因集(gene set)富集分析（不管有無差異，需要全部genes表達值 ...
RNA-Seq分析——KEGG富集分析
入學到現在已經有小半年了，最近正好在做RNA-Seq的分析，記錄一下自己的成長軌跡。 以下是我用clusterProfiler對擬南芥的差異表達基因做的kegg富集分析： # 載入需要的R包 library(clusterProfiler) # 載入我用edgeR得到的差異表達 ...
Bulk RNA-seq 轉錄組分析
Reference : https://cloud.tencent.com/developer/article/1703051 https://blog.csdn.net/weixin_44452 ...
RNA-Seq分析軟件HTSeq的安裝
1.本人剛開始安裝的時候，先下載相關的軟件包，然后安裝installtion中的方法安裝， 運行的時候老是報錯。根據錯誤提示安裝解決方法。也參考了其他的筆友的一些建議， 發現特別麻煩，后來無意中 ...
RNA-seq 基本分析流程
高通量測序技術，就是二代測序，已經成為現代生物學研究的一個較為常規的實驗手段。這一技術的發展極大地推動了基因組學，表觀基因組學以及翻譯組學的研究。RNA-seq 通過測定穩定狀態下的RNA樣品的序列來對RNA樣品進行研究，從而避免了許多之前研究手段的不足，比如象基因芯片或者 PCR 就需要背景知識 ...