1 ChIP-Seq技術 1.1 概念 1.2 ChIP-seq技術原理 2 ChIP-Seq數據分析 2.1 數據下載 2.2 質量控制(data_assess) 2.3 比對到參考基因組 ...
補充RNA seq流程 以前都是自己搭RNA seq流程,雖然可以完成任務,但是數據量一多,批次多起來,就非常難管理。 既然別人提供了這么好的流程,那就要用起來,管理起來不是一般的輕松。 ENCODE DCC rna seq pipeline 安裝比較麻煩,沒有針對local的一鍵安裝,但我們可以借鑒Dockerfile文件里面的安裝方法。 也可以模仿chip seq pipeline scrip ...
2019-12-10 09:57 0 1272 推薦指數:
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A survey of best practices for RNA-seq data analysis RNA-seq數據分析指南 內容 前言 各位同學/老師,大家好,現在由我給大家講講我的文獻閱讀報告! A survey of best practices ...
表觀遺傳 表觀遺傳的3個機制:DNA甲基化;組蛋白修飾;chromatin remodeling 開放染色質測序: 參考:https://zhuanlan.zhihu.com/p/ ...
: 1. RNA-seq分析差異基因,間接推測調控的轉錄因子。 2. 基於大量的ChIP-seq公共數 ...
頗多,需要一點耐心。 各種類型的數據可以直接在這個genome browser里瀏覽:http:// ...
1.下載MACS軟件安裝包(作者的系統為Ubuntu) 網址鏈接:http://liulab.dfci.harvard.edu/MACS/ 2.解壓文件: tar -zxvf MACS**.ta ...
高通量測序技術,就是二代測序,已經成為現代生物學研究的一個較為常規的實驗手段。這一技術的發展極大地推動了基因組學,表觀基因組學以及翻譯組學的研究。RNA-seq 通過測定穩定狀態下的RNA樣品的序列來對RNA樣品進行研究,從而避免了許多之前研究手段的不足,比如象基因芯片或者 PCR 就需要背景知識 ...