原文:ChIP-seq | ATAC-seq | RNA-seq | 數據分析流程

補充RNA seq流程 以前都是自己搭RNA seq流程,雖然可以完成任務,但是數據量一多,批次多起來,就非常難管理。 既然別人提供了這么好的流程,那就要用起來,管理起來不是一般的輕松。 ENCODE DCC rna seq pipeline 安裝比較麻煩,沒有針對local的一鍵安裝,但我們可以借鑒Dockerfile文件里面的安裝方法。 也可以模仿chip seq pipeline scrip ...

2019-12-10 09:57 0 1272 推薦指數:

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Seq數據分析流程RNA

文章目錄 RNA-seq 數據分析流程 相關軟件安裝 下載數據 sra轉fastq格式 數據質控 數據質控,過濾低質量reads,去接頭 比對 ...

Wed Jul 07 02:14:00 CST 2021 0 216
RNA-seq 基本分析流程

高通量測序技術,就是二代測序,已經成為現代生物學研究的一個較為常規的實驗手段。這一技術的發展極大地推動了基因組學,表觀基因組學以及翻譯組學的研究。RNA-seq 通過測定穩定狀態下的RNA樣品的序列來對RNA樣品進行研究,從而避免了許多之前研究手段的不足,比如象基因芯片或者 PCR 就需要背景知識 ...

Wed Feb 27 02:20:00 CST 2013 2 14247
 
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