PacBio公司的業務范圍也就5個(官網): Whole Genome Sequencing Targeted Sequencing Complex Populations RNA Sequencing Epigenetics 其中全基因組測序應該是PacBio ...
基因組測序數據的拼接 組裝 圖片來源:google 每一個物種的參考基因組序列 reference genome 的產生都要先通過測序的方法,獲得基因組的測序讀段 reads ,然后再進行從頭拼接或組裝 英文名稱為do novogenome assembly ,最后還原測序物種的各條染色體的序列,即ATGC四種鹼基的排列順序。 之所以要進行基因組拼接,是因為現在的測序技術還只能測較短的序列,無法 ...
2019-09-27 10:30 0 515 推薦指數:
PacBio公司的業務范圍也就5個(官網): Whole Genome Sequencing Targeted Sequencing Complex Populations RNA Sequencing Epigenetics 其中全基因組測序應該是PacBio ...
)的種類及基於基因組測序數據的鑒定方法。 因為結構變異是造成物種表型差異的一個重要原因,且與各類疾病,特別 ...
項目數據: kongyu_131_PCRfree_.CCAAT_L006_R1_001.fastq.gz (100X)(19G) kongyu_131_PCRfree_.CCAAT_L006_R2_001.fastq.gz (100X)(20G ...
NextDenovo 是有武漢未來組團隊開發出來用於組裝ONT,Pacbio, HIFI (默認參數可對60-100X數據更有效),可通過correct--assemble對其進行組裝。組裝后,每個鹼基正確率為98-99.8%, 可進一步通過NextPolish進行polish。 具體 ...
的選擇 4)質控、基因組組裝、質量評估 5)基因組注釋 6)生物學分析 ...
考慮到cnblog不適合基因組領域這種類型的文章, 最終,我自己開通了公眾號:鹼基礦工,歡迎感興趣的同學關注! 也可以關注我的知乎:https://www.zhihu.com/people/yellowtree/activities 2018年1月修改:這篇文章寫於2013年,首發 ...
序列組裝算法研究(CNKI) 對基因組組裝算法的分析和研究(CNKI) 基於De Bruij ...
與核基因組相比,細胞器基因組相對來說,更為保守,並且序列較短,更加易於組裝,僅僅根據二代測序reads即可進行組裝。 下面簡單介紹我在本項目中的方法,僅供參考。 1 數據 本次我使用的二代數據為50X。下機后,首先通過fastq對其進行過濾,改軟件操作較為簡單,僅僅使用-q 20 ...