用Annovar注釋非人類基因組，如小鼠mm9
annovar一般只包含人類基因組注釋數據庫，其他的物種如小鼠需要自己進行建立注釋信息。 第一步：下載annovar軟件上Annovar官網下載（http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/），現在要郵件 ...
原文：annovar 注釋除人類以外的SNP
. 准備文件： ref.fa ref.gtf或者gff ，最好是gtf ，可將gff 轉化為gtf sample.vcf . 用gff ToGenePred與gtfToGenePred工具將gtf或gff 文件轉化為reference refGene.txt 軟件來自http: hgdownload.soe.ucsc.edu admin exe linux.x gtfToGenePred.dms ...
2019-09-03 12:06 0 358 推薦指數：
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