illumina SNP 芯片轉基因型矩陣
一、芯片數據 此次拿到的illumina芯片數據並不是原始的數據，已經經過GenomeStudio軟件處理成了finalreport文件，格式如下： 之前沒處理過芯片數據，對於這種編碼模式（Forward，top AB）的基因型數據很疑惑，查了很多資料，收效甚微。看過建明大神對芯片這塊 ...
原文：基因型數據正負鏈怎么翻轉(snp flip)
在合並數據過程當中，經常會發現不同來源的數據正負鏈不是統一的，這是一件很頭疼的事。 正負鏈沒有統一的情況下直接合並在一起會產生什么后果呢。 舉個最簡單的例子，假如我們從小明和小紅分別拿到了一批基因型數據。那么存在以下幾種可能： 小明的基因型數據統一好正鏈或者負鏈 小紅的基因型數據統一好正鏈或者負鏈 小明和小紅都不知道他們的數據有沒有統一好，反正數據拿給你了，你自己解決。 在我們不知道這兩人的基因型 ...
2019-07-30 17:16 0 550 推薦指數：
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