原文:序列相似性比較與同源性分析

首先應該注意區分序列相似性與序列同源性的關系,序列相似不一定同源,但是判定同源性關系的時候有些算法 Maximum likelihood除外 要考慮到序列相似性。序列相似性是將待研究序列與DNA或蛋白質序列庫進行比較,用於確定該序列的生物屬性,也就是找出與此序列相似的已知序列是什么,完成這一工作只需要用到兩兩序列比較算法,常用的程序包有BLAST,FASTA等。同源性分析是將待研究序列加入到一組與 ...

2019-07-12 22:18 0 7042 推薦指數:

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時間序列分析 | 相似性度量基本方法

前言 時間序列相似性度量是時間序列相似性檢索、時間序列無監督聚類、時間序列分類以及其他時間序列分析的基礎。給定時間序列的模式表示之后,需要給出一個有效度量來衡量兩個時間序列相似性。時間序列相似性可以分為如下三種: 1、 時序相似性 時序相似性是指時間序列點的增減變化模式相同,即在 ...

Fri Jul 16 23:26:00 CST 2021 0 732
【Matlab】彩色圖像的相似性比較

基於灰度直方圖匹配(直方圖的交),設計並編程實現一種彩色圖像的相似性計算方法。 一、基本思路: 將彩色圖分為三通道(RGB),並計算各自的直方圖,對兩幅圖的RGB三通道分別進行直方圖匹配,最終對三個匹配結果求平均值。 二、算法及算法流程: 1.應用的算法: 2.算法流程: 硬件 ...

Thu Sep 12 17:56:00 CST 2019 0 945
信號相似性的描述

信號相似性的描述 在很多的應用場合,經常要描述兩個信號的相似性。比如在雷達的信號檢測中,要比較所接收的信號是否就是發射信號的延時。有時候,甚至還要描述一個信號本身的相似性,比如在語音編碼中,要通過語音信號本身的相似性,來預測下一時刻的信號值。 我們知道 ...

Wed Dec 11 19:09:00 CST 2013 0 2431
聚類分析(一):相似性度量

1.歐式距離    衡量樣本間相似性和差異性的方法就是計算兩個樣本之間的距離。    對於距離,我們最熟悉的莫過於歐式距離,設\(a=(x_1,x_2,\cdots,x_n),b=(y_1,y_2,\cdots,y_n)\),那么\(a\)和\(b\)的歐式距離定義為: \[ d(a,b ...

Thu Apr 08 06:43:00 CST 2021 0 352
英文句子相似性判斷

1.要求   本次項目提供一系列的英文句子對,每個句子對的兩個句子,在語義上具有一定的相似性;每個句子對,獲得一個在0-5之間的分值來衡量兩個句子的語義相似性,打分越高說明兩者的語義越相近。 如: 2.基本實現過程 2.1 數據處理: (1) 分詞: (2)去停用 ...

Thu Mar 29 05:02:00 CST 2018 0 2831
向量的相似性度量

距離計算方法總結   在做分類時常常需要估算不同樣本之間的相似性度量(Similarity Measurement),這時通常采用的方法就是計算樣本間的“距離”(Distance)。采用什么樣的方法計算距離是很講究,甚至關系到分類的正確與否。   本文的目的就是對常用 ...

Thu Oct 27 05:38:00 CST 2016 0 27949
 
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