可變剪切 | isoform | PSI | 單細胞 | suppa
suppa2繼續測試，這個軟件真的非常好用，速度很快、文檔清晰、使用方便。 suppa核心文件: https://github.com/comprna/SUPPA ~/references/SUPPA2/ref/hg19 ...
原文：SUPPA 可變剪切分析
SUPPA是一款通過轉錄本定量來獲取可變剪切定量結果的軟件。轉錄本的定量方式有很多，例如count，FPKM, TPM等，作者建議使用TPM，因為先均一化了基因的長度，然后均一化了測序的深度。同時建議使用salmon軟件進行定量 軟件的下載與安裝 首先下載salmon二進制版本 下面使用小鼠的轉錄本來建立索引 使用salmon建立索引 SUPPA 的安裝，需要注意的是SUPPA 是使用pytho ...
2019-07-01 14:09 0 1357 推薦指數：
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