1、下載fastqc wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip 2、解壓 unzip fastqc ...
1、下載fastqc wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip 2、解壓 unzip fastqc ...
安裝 FastQC FastQC 下載 解壓 設置權限 加入到 PATH 測試 應該能看到幫助信息,說明已經安裝成功 ...
REF https://www.plob.org/article/5987.html 解壓后,查看html格式的結果報告。結果分為如下幾項: 結果分為綠色的"PASS",黃色的"WARN"和 ...
用FastQC檢查二代測序原始數據的質量 2013-01-28 21:28:10| 分類: Bioinformatics | 標簽:bioinformatics deep-seq |舉報 |字號大中小 訂閱 ...
FastQC FastQC 是一個基於Java寫的測序數據質量評估軟件。因為是用跨平台的語言Java寫的,自然而然FastQC應是可以在不同系統運行的了。不過也許大多時候我們還是在Linux服務器上用的多吧。 安裝 安裝軟件,方便的還是通過conda了,一行命令: 當然這需要你已經安裝 ...
文章轉載於 Original 2017-07-06 Jolvii 生信百科 介紹一下如何理解 FastQC 各模塊的結果 FastQC 的使用 FastQC的安裝介紹請看這里。FastQC 支持 fastq、gzip 壓縮的 fastq、SAM、BAM 等格式,在不指定文件 ...
本文只是博主在編寫過程中遇到的一些問題,歡迎大家留言繼續補充! 一、開發工具相關錯誤: 01、引用別人的工程,出現的可能的錯誤 多半是因為jdk版本的原因,調整一下即可: 解決方法:Build Path ==> ...
1.從官網下載FastQC https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/ 2.解壓文件,並進入該文件 將其至於某個文件夾,unzip fastqc_v0.11.5.zip. 3.進入解壓目錄,設置可執行權限 ...