原文:學習筆記49—matlab FDR校正

matlab自帶函數mafdr,當ttest數較多時,可直接用 FDR, Q mafdr P 但是Storey procedure在p值少於 個時會崩潰,此時應改用BH FDR方法:mafdr P, BHFDR , true 。該方法對於少量ttest更穩健,但是更保守。 參考鏈接: https: stat.ethz.ch pipermail bioconductor January .html ...

2019-01-08 17:40 0 911 推薦指數:

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matlab FDR校正

http://home.52brain.com/forum.php?mod=viewthread&tid=27066&page=1#pid170857 http://www.math ...

Sat Nov 28 17:46:00 CST 2015 0 4747
學習筆記50—多重假設檢驗與Bonferroni校正FDR校正

總結起來就三句話: (1)當同一個數據集有n次(n>=2)假設檢驗時,要做多重假設檢驗校正 (2)對於Bonferroni校正,是將p-value的cutoff除以n做校正,這樣差異基因篩選的p-value cutoff就更小了,從而使得結果更加嚴謹 (3)FDR校正是對每個 ...

Wed Jan 09 01:49:00 CST 2019 0 689
FDR校正

一、假設檢驗 假設檢驗的基本思路是: 設立零假設(null hypothesis)H0,以及與零假設H0相對應的非零假設(alternative hypothesis)H1,在假設H0成立的前提下 ...

Mon Aug 03 05:06:00 CST 2020 0 699
SPM FDR校正

來源: http://blog.sciencenet.cn/blog-479412-572049.html,http://52brain.com/thread-15512-1-1.html SPM8允許兩種FDR校驗。一個是voxel-wise FDR,另一個是topological ...

Wed Oct 28 23:41:00 CST 2015 0 3154
淺談多重檢驗校正FDR

淺談多重檢驗校正FDR Posted: 四月 12, 2017 Under: Basic By Kai no Comments 例如,在我們對鑒定到的差異蛋白做GO功能注釋后,通常會計算一個p值。當某個蛋白的p值小於0.05(5%)時,我們通常認為這個蛋白在兩個樣本中的表達 ...

Sat Nov 10 05:37:00 CST 2018 0 2238
matlab學習筆記(4)

第9章 數學建模函數 曲線擬合: 多項式擬合: polyfit()函數:采用最小二乘法進行多項式擬合。   polyfit(x,y,n); %對於數據集[x,y],找到次數為n的多項 ...

Tue Feb 28 19:42:00 CST 2017 0 1500
Matlab學習筆記(五)

三、矩陣運算 (一)矩陣函數和特殊矩陣 常見的矩陣處理函數 表3-1 常見的矩陣函數 函數 說明 ...

Thu Mar 07 06:46:00 CST 2019 1 565
MATLAB學習筆記(二)——主要是MATLAB的矩陣知識

PS:主要是講解矩陣的相應的實現方法,其實MATLAB的很大一部分的優勢,就是集成了矩陣級別的運算,並以此為特點,可以進行多維空間上的驗證。 讓我們懂得了原來線性代數如此有用= - =。 (一)MATLAB矩陣 一、矩陣的建立 1、直接輸入法創建: 還可 ...

Tue Jan 13 09:20:00 CST 2015 0 20854
 
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