RNA-Seq分析——KEGG富集分析
入學到現在已經有小半年了，最近正好在做RNA-Seq的分析，記錄一下自己的成長軌跡。 以下是我用clusterProfiler對擬南芥的差異表達基因做的kegg富集分析： # 載入需要的R包 library(clusterProfiler) # 載入我用edgeR得到的差異表達 ...
原文：RNA-seq(9):功能富集分析
這部分開始進行基本的富集分析，兩類 A：差異基因富集分析 不需要表達值，只需要gene name B: 基因集 gene set 富集分析 不管有無差異，需要全部genes表達值 A：差異基因富集分析 不需要表達值，只需要gene name 先說富集什么 最常用的基因注釋工具是GO和KEGG注釋，這基本上是差異基因分析一定做的兩件事。GO可以在GO:BP 生物過程 ，GO:MF 分子功能 ，GO ...
2018-12-15 11:18 0 1543 推薦指數：
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