目錄 相關鏈接 蛋白質模建的幾種方法 同源模建 折疊識別 從頭預測 綜合方法 實地操作&預測結果 路線 預測結果 Swiss ...
一 modeller下載與安裝 輸入key碼:MODELIRANJE 做下Basic Modeling 流程吧: 在python環境下運行下例子吧: build profile.py compare.py align d.py model single.py evaluate model.py 這里還需要一個evaluate template文件 二 使用modeller對目的蛋白序列同源建模 ...
2018-12-11 14:22 0 1486 推薦指數:
目錄 相關鏈接 蛋白質模建的幾種方法 同源模建 折疊識別 從頭預測 綜合方法 實地操作&預測結果 路線 預測結果 Swiss ...
一、氨基,羧基和氨基酸 氨基:-NH2 氨基是基本鹼基,大多數含有氨基的有機物都有一定鹼的特性。氨基是一個活性大、易被氧化的基團。 羧基:-COOH。分子中具有羧(念suo)基的化合物稱為羧酸 ...
I-TASSER是一款用於預測蛋白質結構和功能的工具,網站鏈接:https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/ 具體描述如下: I-TASSER (Iterative Threading ASSEmbly Refinement ...
Swiss-model也是一款預測蛋白質結構模型的工具。網頁地址:https://swissmodel.expasy.org/ 首先,進行常規的注冊后,點擊start modelling 以搜索BRCA1蛋白質為例: 進入NCBI的protein網頁:https ...
目錄 1.簡介 2.安裝運行 3.結果 1.簡介 MSGF+也是近年來應用得比較多的蛋白鑒定軟件。java寫的,2008年初次發表JPR,2014年升級發表NC,免費開源,持續更新維護,良心軟件。而且,有研究者對不同蛋白質組學鑒定軟件進行比較分析 ...
參考文章http://www.biotrainee.com/thread-1465-1-1.html http://blog.sina.com.cn/s/blog_83f77c940102vny ...
1. 實驗設計與技術路線 (1) 常用流程 流程 說明 1.材料收集 細胞、細胞上清、組織、血漿、血清、腦脊液、外泌體、尿液...... 2.定量技術 蛋白組:iTRAQ/TMT ...
原創 2017-05-08 omicshare.com 基迪奧生物 蛋白質二級結構的預測通常被認為是蛋白結構預測的第一步,二級結構是指α螺旋和β折疊等規則的蛋白質局部結構元件。不同的氨基酸殘基對於形成不同的二級結構元件具有不同的傾向性。按蛋白質中二級結構的成分可以把球形蛋白分為全 ...