RNA-seq表達數據之樣本PCA分析
Principal component analysis (PCA) 分析 主成分分析(PCA)幫助我們歸納總結和可視化數據集中的信息，這些數據包含由多個相互關聯的變量描述的個體 / 觀察主成分分析。 可以將每個變量視為不同的維度。 但如果您的數據集中有3個以上的變量，那么很難在多維超空間可視化 ...
原文：RNA-seq中的基因表達量計算和表達差異分析
RNA seq中的基因表達量計算和表達差異分析 差異分析的步驟： 比對 read count計算 read count的歸一化 差異表達分析 背景知識： 比對：普通比對： BWA，SOAP開大GAP比對：Tophat Bowtie Read count 多重比對的問題 ：丟棄平均分配利用Unique region估計並重新分配表達量計算的本質目標基因表達量相對參照系表達量的數值。參照的本質： 假設 ...
2018-11-13 10:50 0 5028 推薦指數：
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