原文:NGS基礎 - 高通量測序原理

NGS基礎 高通量測序原理 原創:贔屓生信寶典 NGS系列文章包括NGS基礎 轉錄組分析 ChIP seq分析 DNA甲基化分析 重測序分析五部分內容。 NGS基礎系列文章包括高通量測序原理,測序數據獲取和質量評估,常見文件格式解釋和轉換 部分。 本文 高通量測序原理 涉及測序文庫構建原理 連特異性文庫的構建方式和識別方法 測序簇生成過程 雙端測序過程 測序接頭產生 PCR duplicate 測 ...

2018-10-19 18:28 0 2435 推薦指數:

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測序總結,高通量測序名詞

測序總結,高通量測序名詞 主要來自 :http://mp.weixin.qq.com/s/iTnsYajtHsbieGILGpUYgQ 測序的黃金標准:一代測序了,故稱之為黃金測序高通量測序最近這幾年很火越來越火,但是世界上更多的還是一幫天天做分子克隆 ...

Tue Oct 16 05:32:00 CST 2018 0 1199
高通量測序中的reads、contig、scaffold什么意思?

高通量測序數據分析: 高通量測序中,reads、contigs、scaffold、unigene、singleton各是什么,有什么關系? 1. 什么是read? 高通量測序時,在芯片上的每個反應,會讀出一條序列,是比較短的,叫read,它們是讀序;就是我們測序產生的短讀序列,通常一代和三代 ...

Sun Oct 11 05:24:00 CST 2020 0 2768
國內高通量基因測序公司成立 時間表

可以發現幾個規律: 14年之前的公司主營業務都是科技服務 14年之后成立的公司幾乎沒有奔着科技服務去的,行業開始分化,主要是做基因檢測、個人基因組、液體活檢; ...

Sat Jan 19 23:31:00 CST 2019 0 733
高通量測序中,read、contig和Scaffold分別是什么

1.什么是Reads? 高通量測序平台產生的序列就稱為reads。 2.什么是Contig? 拼接軟件基於reads之間的overlap區,拼接獲得的序列稱為Contig(重疊群)。 3.什么是Scaffold? 基因組de novo測序,通過reads拼接 ...

Sat Feb 20 18:23:00 CST 2021 0 277
用FastQC檢查高通量測序原始數據的質量

本篇文章,主要參考了陽光1986的博文(http://www.dxy.cn/bbs/topic/31324367),自己測序的分析結果作為對比,加在其中了。 1.簡介 當二代測序的原始數據拿到手之后,第一步要做的就是看一看原始reads的質量。常用的工具就是fastqc (http ...

Sun Dec 27 04:09:00 CST 2015 0 6985
 
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