原文:TPM、read counts、RPKM/FPKM你選對了嗎?

TPM read counts RPKM FPKM你選對了嗎 已有 次閱讀 : 個人分類:RNA seq 系統分類:科普集錦 關鍵詞:RNA seq RNA seq 本文轉載自嘉因微信公眾號,已獲得授權。查看最新文章,敬請關注嘉因,微信ID:rainbow genome 作者:小哈 來源:嘉因 在RNA測序分析,哪家公司適合我一文中,聊過類似的問題。 這次小哈搬來了statQuest的 個最新視 ...

2018-10-18 21:37 0 1316 推薦指數:

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FPKM/RPKM以及TPM的理解

FPKM/RPKM以及TPM的理解 2018年07月03日 16:05:53 sixu_9days 閱讀數:559 標簽: FPKM/RPKMTPMRNA-Seq 更多 個人分類: RNA-Seq ...

Thu Oct 18 18:49:00 CST 2018 0 949
【生物信息】RPKM, FPKMTPM

注:這幾個名詞是RNA-Seq數據分析中的基礎,在此小結一下。 在RNA-Seq的分析中,對基因或轉錄本的read counts數目進行標准化(normalization)是一個極其重要的步驟,因為落在一個基因區域內的read counts數目取決於基因長度和測序深度。很容易理解:一個基因 ...

Mon Jul 06 23:38:00 CST 2020 0 6012
RNA-Seq分析|RPKM, FPKM, TPM, 計算對比

在分析了若干轉錄組之后發現,處理數據的時候最重要的不是技巧多么絢麗,你調包的能力有多么強。而是把基本的概念特別是統計和數學上的方法咬爛嚼吐,才是真正理解和掌握了分析數據的底層原理: 在RNA-Seq的分析中,對基因或轉錄本的read counts數目進行normalization是一個 ...

Fri Jul 06 05:50:00 CST 2018 0 914
轉錄組表達量計RPKMFPKMTPM說明

在轉錄組測序(RNA-Seq)中,基因的表達量是我們關注的重點。基因表達量的衡量指標有:RPKMFPKMTPMRPKM:Reads Per Kilobase Million;說實話,這個英文說明真的很費解,其實可以理解為“Reads Per Kilobase Per Million ...

Sat Apr 28 06:03:00 CST 2018 0 31657
基因表達量表示方法 RPKM VS FPKM VS TPM

之前不是很理解這兩個概念,看了本文之后就差不多理解了。 基因組學技術專題(二):為什么說FPKM/RPKM是錯的 轉自:安諾基因 我們都知道RNA-seq是通過NGS技術來檢測基因表達量的測序方法。在衡量基因表達量方面,若是單純以比對到參考基因的Reads個數(我們通常稱之為Count值 ...

Thu Feb 16 00:24:00 CST 2017 0 1485
初學編程,選C還是選C++,你選對了嗎

如果手頭有一個強大的C ++編譯器,切勿使用C。 如果需要,可以使用禁止C ++的所有功能的編碼約定,包括標准C ++庫,異常,RTTI以及C ++符號修飾。 但是,C ++具有許多可以編寫代碼的 ...

Sun Sep 20 03:36:00 CST 2020 0 625
開源API網關,你選對了么?

開源API網關,你選對了么? api網關的本質 不用扯那么多,也不用畫圖,一句話說清楚 api網關:流量總入口,得以集中控制! 就這么簡單 api網關協議上最基本要支持HTTP 和 WebSocket,功能強大點的更會支持tcp/udp的負載均衡接入 正因為支持的是http協議,所以api ...

Fri Jan 10 06:52:00 CST 2020 1 5031
 
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