鏈特異性轉錄組測序 非鏈特異性轉錄組測序信息不包含鏈方向的特征信息,對正義和反義轉錄本無法准確判斷,導致無法反映真實的轉錄情況。而鏈特異性轉錄組測序(strand-specific RNA seq)可以解決這個問題。鏈特異性建庫的方式是在合成cDNA的第二條鏈時 ...
對鏈特異性建庫的理解 年 月 日 : : sixu days閱讀數: 標簽:鏈特異性建庫LncRNA seq更多 個人分類:RNA Seq 剛接觸高通量測序的時候就知道有鏈特異性建庫這么個概念,當時也了解可以利用加U法,但是沒有思考其中的細節。最近把這個概念掰開了揉碎了好好理解,終於填上了這個坑。 正式講之前,有幾個概念是要明確的。 DNA 的正鏈和負鏈,就是那兩條反向互補的鏈。參考基因組給出的 ...
2018-10-18 10:50 0 1265 推薦指數:
鏈特異性轉錄組測序 非鏈特異性轉錄組測序信息不包含鏈方向的特征信息,對正義和反義轉錄本無法准確判斷,導致無法反映真實的轉錄情況。而鏈特異性轉錄組測序(strand-specific RNA seq)可以解決這個問題。鏈特異性建庫的方式是在合成cDNA的第二條鏈時 ...
參考文獻:http://www.jianshu.com/p/a63595a41bed http://kaopubear.top/categories/ ...
眾所周知,全基因組關聯分析(GWAS)發現的很多變異位點基本為非編碼,這些變異位點1)要么調控基因表達(eQTL); 2)要么影響增強子活性; 3)要么影響轉錄因子(TF)結合特異性; 4)要么啥也不是。 針對以上四種情況: 1)是否調控基因表達(eQTL)可通過GTEx(https ...
https://blog.csdn.net/dgyuanshaofeng/article/details/78686117 Sensitivity,我們常說“敏感性”、“靈敏性”、“召回率”或者“查 ...
(Sen): Sen=TP/(TP+FN)*100% 特異性 Specificity (Spe) s ...
二、下載對比數據庫 下載地址:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast ...
位點特異性重組 和 DNA轉座 視頻 https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition J.D. Watson et. al 很多重要DNA重排是由兩類重要遺傳 ...
目錄 1. 主要參考文獻 1) 綜述 2)研究和方法 水稻PNAS——張啟發、刑鋒 棉花NC——胡冠菁、包穎 ...