GATK
GATK使用簡介 Part1/2 GATK(全稱The Genome Analysis Toolkit)是Broad Institute開發的用於二代重測序數據分析的一款軟件，里面包含了很多有用的工具。 網址：http://www.broadinstitute.org/gsa/wiki ...
原文：GATK --- wdl 語言
GATK的pipeline使用WDL進行編寫 WDL是一種流程管理語言，內置的支持並行，適合編寫pipeline 運行wdl腳本需要兩步：第一步編輯參數列表對應的json文件，第二步直接運行Cromwell.jar eg 對於一個WDL腳本，有 個核心結構： ，workflow , task：代表任務，讀取輸入文件，執行相應的commond，然后輸出output。task中可以有參數。 ， cal ...
2018-10-16 17:24 0 1485 推薦指數：
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