質控工具之TrimGalore使用方法
TrimGalore 就是一個簡單的perl wrapper，打包了fastqc和cutadapt，但是卻非常實用。 因為cutadapt的參數選擇實在是有夠復雜，光接頭類型就有5種，還有各種參數，大哥，我就想去去接頭、trim一下質量而已，你就不能自動搞了嗎。不要給選擇困難症的我這么多 ...
原文：質控工具之cutadapt的使用方法
cutadapt 參考：用cutadapt軟件來對雙端測序數據去除接頭 fastqc可以用於檢測，檢測出來了怎么辦 看了幾篇高水平文章，有不少再用cutadapt，雖然有時候數據真的不錯，但是還是要質控一下，修剪一下。 cutadapt a ADAPTER FWD A ADAPTER REV o out. .fastq p out. .fastq reads. .fastq reads. .fas ...
2018-03-26 20:03 0 1357 推薦指數：
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