質控工具之cutadapt的使用方法


cutadapt

參考:用cutadapt軟件來對雙端測序數據去除接頭

 

fastqc可以用於檢測,檢測出來了怎么辦?

看了幾篇高水平文章,有不少再用cutadapt,雖然有時候數據真的不錯,但是還是要質控一下,修剪一下。

 

cutadapt -a ADAPTER_FWD -A ADAPTER_REV -o out.1.fastq -p out.2.fastq reads.1.fastq reads.2.fastq

  

 

待續~

 


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