Fst指數說明
群體遺傳學--Fst指數，即群體間分化指數，用於群體間分化分析。 群體遺傳學中衡量群體間分化程度的指標有很多種，最常用的就是Fst指數。Fst指數，由F統計量演變而來。F統計量（FIS，FIT，FST）主要有三種。Fst是針對一對等位基因，如果基因座上存在復等位基因，則需要用Gst ...
原文：使用vcftools或者gcta計算群體間固定指數（Fixation index，FST）
下列所用到的數據均為千人基因組數據庫 通過vcftools計算FST 命令行如下： 其中，input data.vcf就是輸入的vcf格式 population .txt的格式如下： population .txt的格式同population .txt，只有一列sample名字的信息。 計算之后，會得到兩個文件格式，分別為.log和.fst,如圖下所示： 通過gcta計算FST 命令行如下： 其中 ...
2018-03-15 11:22 5 3939 推薦指數：
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