Fst指數說明


群體遺傳學--Fst指數,即群體間分化指數,用於群體間分化分析。

群體遺傳學中衡量群體間分化程度的指標有很多種,最常用的就是Fst指數。Fst指數,由F統計量演變而來。F統計量(FIS,FIT,FST)主要有三種。Fst是針對一對等位基因,如果基因座上存在復等位基因,則需要用Gst衡量,基因差異分化系數(gene differentiation coefficient,Gst)。
 
從配子間親緣關系角度分析,FST和FIT分別相當於地方群體和整個群體中攜帶的一對等位基因是同源的概率,而FST是從兩個地方群體中任意抽取的兩個配子是同源的概率。從兩個地方群體中任意抽取的兩個配子是同源的概率大,表明兩個地方群體的遺傳組成相似,分化程度低;反義,分化程度高。
 
FST取值范圍[0,1],最大值為1,表明等位基因在各地方群體中固定,完全分化;
最小值為0,意味着不同地方群體遺傳結構完全一致,群體間沒有分化。
 
Fst(Fixation index)通常用來衡量population之間的genetic distance。1說明兩個population是完全獨立的。0說明兩個population之間自由interbreeding。Fst值越大,說明genetic distance越遠。值越低,說明大多數的genetic variation是發生在同一個population的。
 
Wright建議,實際研究中,FST為0~0.05:群體間遺傳分化很小,可以不考慮;
FST為0.05~0.15,群體間存在中等程度的遺傳分化;
FST為0.15~0.25,群體間遺傳分化較大;
FST為0.25以上,群體間有很大的遺傳分化。


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