vcftools安裝與使用

官網地址：https://vcftools.github.io/examples.html

vcftools的軟件下載：https://vcftools.github.io/examples.html

安裝

第一種情況的：

tar -xvf vcfools.0.X.XX.tar.gz
export PERL5LIB=/path/to/your/vcftools-directory/src/perl/
cd vcftools/ 
./configure	
make 
make install

第二種情況：

cd vcftools/ 
./autogen.sh 
./configure	
make 
make install

　

 使用

# 用vcftools軟件將vcf格式圍成genotype252.map和genotype252.ped兩個文件
vcftools --vcf genotype_252_填補.hmp.vcf --plink --out genotype252