Pathway富集分析氣泡圖
data.tsv > pathway = read.table("data.tsv",header = T, sep="\t") > library(ggplot2) > p = ggplot(pathway,aes(Pvalue,Pathway)) > ...
原文：pathway-pathway network 網絡分析
對於pathway 數據庫而言，我們最常見的就是利用KEGG 富集分析挖掘其中的信息，得到顯著富集的幾條通路 對於代謝通路而言，不同的通路之間是會有相互關系的，比如在上游的通路中產生的代謝產物，進入下游的通路繼續發揮作用。 pathway和pathway 之間存在一個上下游的關系，所有的pathway 的相互關系就構成了 個網絡，在這個網絡中，肯定會存在degree比較多的pathway, 所以通 ...
2018-02-23 15:17 0 1317 推薦指數：
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