原文:蛋白質結構模型和功能預測:Swiss-model工具的使用

Swiss model也是一款預測蛋白質結構模型的工具。網頁地址:https: swissmodel.expasy.org 首先,進行常規的注冊后,點擊start modelling 以搜索BRCA 蛋白質為例: 進入NCBI的protein網頁:https: www.ncbi.nlm.nih.gov protein ,輸入要查詢的BRCA 點擊搜索后,選擇最后的氨基酸序列: 將所有的序列黏貼后回 ...

2017-12-01 17:07 0 10979 推薦指數:

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蛋白質結構模建初探

目錄 相關鏈接 蛋白質模建的幾種方法 同源模建 折疊識別 從頭預測 綜合方法 實地操作&預測結果 路線 預測結果 Swiss ...

Fri Apr 17 07:19:00 CST 2020 0 592
1、蛋白質二級結構預測方法

原創 2017-05-08 omicshare.com 基迪奧生物 蛋白質二級結構預測通常被認為是蛋白結構預測的第一步,二級結構是指α螺旋和β折疊等規則的蛋白質局部結構元件。不同的氨基酸殘基對於形成不同的二級結構元件具有不同的傾向性。按蛋白質中二級結構的成分可以把球形蛋白分為全 ...

Thu Jun 15 22:32:00 CST 2017 0 11882
AI 預測蛋白質結構「GitHub 熱點速覽 v.21.29」

作者:HelloGitHub-小魚干 雖然 AI 領域藏龍卧虎,但是本周預測蛋白質結構的 alphafold 一開源出來就刷爆了朋友圈,雖然項目與我無關,但是看着科技進步能探尋到生命機理,吃瓜群眾也有點小激動。雖然不能參與這個了不起的項目,但是我們可以手持編程書籍參與 ...

Tue Jul 20 17:12:00 CST 2021 0 453
蛋白質組DIA深度學習之譜圖預測

目錄 1. 簡介 2. 近幾年發表的主要工具 1.DeepRT 2.Prosit 3. DIANN 4.DeepDIA 1. 簡介 基於串聯質譜的蛋白質組學大部分是依賴於數據庫(database search ...

Thu Aug 06 00:48:00 CST 2020 0 2136
【宏蛋白質組】搜庫工具簡介與評估

蛋白質組數據分析相對較難,不同於常規蛋白質組分析,因為數據庫太大,無法直接進行搜庫匹配,需要對數據庫進行優化。整理了幾個發表的宏蛋白搜庫分析工具。具體效果如何,還需要測試。 1.ProteoStorm 發表:ProteoStorm: An Ultrafast Metaproteomics ...

Fri Mar 20 07:00:00 CST 2020 0 1015
氨基酸,多肽,蛋白質

一、氨基,羧基和氨基酸 氨基:-NH2 氨基是基本鹼基,大多數含有氨基的有機物都有一定鹼的特性。氨基是一個活性大、易被氧化的基團。 羧基:-COOH。分子中具有羧(念suo)基的化合物稱為羧酸。 氨基酸,結構中含有胺基和羧基,並且胺基和羧基都是直接連接在一個-CH-結構上的有機化合 ...

Mon Jul 26 07:36:00 CST 2021 0 318
 
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