是為什么這兩個包算出來的結果直接是logfoldchange . deseq2 包計算差異使用的是r ...
安裝R包 RcppArmadillo 失敗,導致依賴該包的DESeq 無法使用 首先對gcc,g 升級至 . , 但依然報錯,還是安裝不了RcppArmadillo 報錯如下: R gt source https: bioconductor.org biocLite.R gt biocLite DESeq BioC mirror: https: bioconductor.org Using Bi ...
2017-02-16 13:15 0 2410 推薦指數:
是為什么這兩個包算出來的結果直接是logfoldchange . deseq2 包計算差異使用的是r ...
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在安裝‘DESeq2’這個包的最后出現上面的錯誤。可以看出是‘Biobase’這個包有問題。重新安裝此包后,再一次安裝‘DESeq2’,安裝成功。 library('DESeq2')出現下面問題: 缺少GenomeInfoDb包,繼續安裝 ...
1) MA圖 對於MA圖而言, 橫坐標為該基因在所有樣本中的均值,basemean = (basemean_A + basemean_B ) / 2, ...
簡單使用DESeq2/EdgeR做差異分析 Posted: 五月 07, 2017 Under: Transcriptomics By Kai no Comments DESeq2和EdgeR都可用於做基因差異表達分析,主要也是用於RNA-Seq數據,同樣也可以處理類似 ...
如何安裝R語言包詳見: Linux安裝R語言包 使用公共路徑上的R軟件,如何擁有自己的library: R中用.libPaths()函數查看lib路徑,如果有多個lib,install.packages()默認是安裝在第一個目錄下 修改.bashrc文件中R lib路徑的環境變量 ...
installing via 'install.libs.R' to C:/Program Files/R/R-3.6.0/library/00LOCK-stringi/00new/stringi downloading the ICU data library (icudt) output ...
今天看論文,需要用到R語言的庫,於是又折騰了半天.. 其實並沒有什么太大的問題,只是在第三方包的下載方面還有python中使用R方面遇到了問題: 第三方包的導入 其實在網上有很多的方法了,R中包的安裝 先說結論:最推薦直接使用install ...