原文:12、IGV-Integrative Genomics Viewer

IGV的網址:http: software.broadinstitute.org software igv java環境 常見的幾種輸入格式bam sam 比對文件 TDF bam的精簡版 bed 注釋文件 gtf gff 注釋文件 PSL blat比對結果 VCF snp,indel的信息 WIG UCSC數據庫推薦格式wiggle track format IGV IGV默認的格式 操作指南 ...

2017-06-04 22:12 0 2076 推薦指數:

查看詳情

Integrative Genomics Viewer (IGV)

http://software.broadinstitute.org/software/igv/igvtools_commandline Running igvtools from the Command Line Downloading ...

Sat Mar 18 00:41:00 CST 2017 0 1537
IGV解讀

復制於:https://www.cnblogs.com/leezx/p/5603481.html 整合基因組瀏覽器(IGV)是一種高性能的可視化工具,用來交互式地探索大型綜合基因組數據。它支持各種數據類型,包括array-based的和下一代測序的數據和基因注釋。IGV這個工具很牛,發了NB ...

Fri Jul 26 02:13:00 CST 2019 0 1016
[Linux] IGV使用說明

做完mapping之后,需要知道mapped reads在基因組上的分布,所以嘗試在ubuntu系統中使用IGV軟件,簡單記錄使用過程,如下:1.下載IGV軟件  去IGV官網: http://www.broadinstitute.org/software/igv/download,下載 ...

Sat Mar 18 05:14:00 CST 2017 0 4245
VNC Viewer

首先需要明確,什么事VNC , Virtual Network Computing ,VNC允許Linux系統可以類似實現像Windows中的遠程桌面訪問那樣訪問Linux桌面。 首先試試服務器裝了 ...

Sat Apr 29 21:56:00 CST 2017 0 2489
單細胞測序 10x genomics

單細胞轉錄組 從研究方向看上,發育生物學、免疫、神經生物學、腫瘤是排名靠前的方向,這和我們平時遇到的高頻研究方向基本吻合。另外,作為一個新興的領域,10X 單細胞轉錄組檢測到細胞多,數據龐大, ...

Thu Jul 01 01:14:00 CST 2021 0 223
什么是SCADA Viewer

SCADA Viewer 什么是SCADA Viewer SCADA Viewer是一個基於Web的軟件框架(基於Web的HMI/SCADA/M2M工業和樓宇自動化,支持Modbus,BACnet,OPC,SQL...),應用程序開發人員可以用它來構建輕量級的,完全定制的過程控制 ...

Tue Jan 03 21:45:00 CST 2017 0 6149
單細胞 RNA-seq 10X Genomics

單細胞流程跑了不少,但依舊看不懂結果,是該好好補補了。 有些人可能會誤會,覺得單細胞的RNA-seq數據很好分析,跟分析常規的RNA-seq應該沒什么區別。今天的這篇文章2015年3月發表在N ...

Sat May 27 00:06:00 CST 2017 0 13409
 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM