gene-based關聯分析研究是SNP-based關聯分析研究的一個補充。 目前有很多工具支持gene-based關聯分析研究，比如GCTA，VEGAS2等。 下面主要介紹一下怎么用VEGAS2做gene-based的關聯分析研究。 先說VEGAS2的優點，輸入特別簡單，不需要准備太多 ...

本文為入門級的基因調控網絡文章，主要介紹一些基本概念及常見的GRN模型。 概念：基因調控網絡 (Gene Regulatory Network, GRN)，簡稱調控網絡，指細胞內或一個基因組內基因和基因之間的相互作用關系形成的網絡，特指基因調控 (gene regulation) 導致基因 ...

Study）進行gene based的關聯分析研究。 但用過的人就知道，VEGAS2有個很明顯的缺點 ...

之前已經寫過兩篇gene-based 關聯分析研究，感興趣翻往期推文： 基於GCTA的gene-based關聯分析研究 使用VEGAS2（Versatile Gene-based Association Study）進行gene based的研究 今日再介紹第三款軟件：MAGMA 跟前 ...

ceRNA 不同於mRNA, lncRNA, ncRNA 等概念，其指的既不是某一種類型的RNA(比如mRNA, lncRNA), 也不是某一類的RNA(如ncRNA); ceRNA 其實指的是不同種類的RNA之間的調控機制，英文名為 competing endogenous RNA , 翻譯成 ...

gene symbol： TP53 gene ID：7157。Entrez Gene ID，它是目前國際上最權威的Gene ID編號！ GENECODE：GENECODE來自Ensembl數據庫。沒有ID。它有gtf文件。 HGNC（人類基因命名委員會）只對人類基因進行命名 ...

1 引言 網絡報文抓取是指通過對主機網絡設備的探測，實現獲取該網絡當前傳輸的所有信息，並根據信息的源主機、目標主機、服務協議和端口等信息簡單過濾掉不關心數據，然后提交給上層應用程序進行進一步處理。 2 網絡數據包捕獲原理 一個包捕獲機制包含三個主要部分 1） 包捕獲機制 ...

為了查找某個研究領域的相關信息，生物學家往往要花費大量的時間，更糟糕的是，不同的生物學數據庫可能會使用不同的術語，好比是一些方言一樣，這讓信息查找更加麻煩，尤其是使得機器查找無章可循。Gene Ontology就是為了解決這種問題而發起的一個項目。 Gene Ontology中最基本的概念 ...