GCTA(全基因組復雜性狀分析)工具開發目的是針對復雜性狀的全基因組關聯分析,評估SNP解釋的表型方差所占的比例(該網站地址:http://cnsgenomics.com/software/gcta/)。目前GCTA工具可實現以下功能: 1 評估全基因組SNP的親緣關系(遺傳關系) 2 評估全 ...
如文章 Genome wide Complex Trait Analysis GCTA 全基因組復雜性狀分析 中介紹的GCTA,是一款基於全基因組關聯分析發展的分析工具,除了計算不同性狀 表型間 traits 的遺傳相關性外,還可以計算親緣關系 近交系數 ,下面簡單介紹如何利用GCTA計算不同性狀 表型的遺傳相關性。 一,在Linux上安裝GCTA工具: wget r np pk nH P . t ...
2016-12-25 16:05 44 4801 推薦指數:
GCTA(全基因組復雜性狀分析)工具開發目的是針對復雜性狀的全基因組關聯分析,評估SNP解釋的表型方差所占的比例(該網站地址:http://cnsgenomics.com/software/gcta/)。目前GCTA工具可實現以下功能: 1 評估全基因組SNP的親緣關系(遺傳關系) 2 評估全 ...
這篇文章是對之前啊啊救救我,為何我的QQ圖那么飄(全基因組關聯分析)這篇文章的一個補坑。 LD SCore除了查看顯著SNP位點對表型是否為基因多效性外,還額外補充了怎么計算表型的遺傳度和遺傳相關性。 1 下載、安裝ldsc git clone https://github.com ...
計算復雜度 計算復雜度由算法決定,一個數學問題通常可同時有多個解決算法,而計算復雜度可表述算法的復雜程度,在密碼設計和密碼分析中具有重要作用。計算復雜性理論不僅反映密碼破譯的固有困難性,評測密碼算法對抗密碼破譯的實際能力,還能為不同密碼算法實現難度的分析與比較提供了方法。 算法復雜 ...
遺傳相關的計算之前介紹過幾次了,感興趣的翻之前的推文: 1、利用GCTA工具計算復雜性狀/特征(Complex Trait)的遺傳相關性(genetic correlation) 2、LD SCore計算基因多效性、遺傳度、遺傳相關性 之前的兩篇推文均有一個小局限,就是針對多個表型間的遺傳 ...
NP完全性理論的奠基人—1982年度圖靈獎得主斯蒂芬·庫克 ---- 加拿大多倫多大學教授斯蒂芬·庫克(Stephen Arthur Cook)因其在計算復雜性理論方面的突出貢獻,尤其是在奠定NP完全性理論基礎上的突出貢獻而榮獲1982年度的圖靈獎。但庫克實際上是美國科學家。 ----庫克 ...
分析連續變量之間的線性相關程度的強弱 相關性分析是指對兩個或多個具備相關性的變量元素進行分析,從而衡量兩個變量因素是相關密切程度。 1,圖示初判 2,Pearson相關系數(皮爾遜相關系數) 3,Sperman秩相關系數(斯皮爾曼相關系數) 1,圖示初判 (1)變量之間的線性相關性 ...
的不可計算 Kolmogorov復雜性的鏈式法則 壓縮 Chaitin的不完備 ...
http://student.zjzk.cn/course_ware/software/txt/txt/show.asp?filename=11_3.txt 11.3 軟件復雜性11.3.1 軟件復雜性的基本概念 軟件復雜性度量的參數很多,主要有: (1) 規模,即總共的指令數 ...