原文:利用GCTA工具計算復雜性狀/特征(Complex Trait)的遺傳相關性(genetic correlation)

如文章 Genome wide Complex Trait Analysis GCTA 全基因組復雜性狀分析 中介紹的GCTA,是一款基於全基因組關聯分析發展的分析工具,除了計算不同性狀 表型間 traits 的遺傳相關性外,還可以計算親緣關系 近交系數 ,下面簡單介紹如何利用GCTA計算不同性狀 表型的遺傳相關性。 一,在Linux上安裝GCTA工具: wget r np pk nH P . t ...

2016-12-25 16:05 44 4801 推薦指數:

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Genome-wide Complex Trait Analysis(GCTA)-全基因組復雜性狀分析

GCTA(全基因組復雜性狀分析)工具開發目的是針對復雜性狀的全基因組關聯分析,評估SNP解釋的表型方差所占的比例(該網站地址:http://cnsgenomics.com/software/gcta/)。目前GCTA工具可實現以下功能: 1 評估全基因組SNP的親緣關系(遺傳關系) 2 評估全 ...

Sat Oct 22 06:03:00 CST 2016 0 1416
算法的計算復雜性

計算復雜度   計算復雜度由算法決定,一個數學問題通常可同時有多個解決算法,而計算復雜度可表述算法的復雜程度,在密碼設計和密碼分析中具有重要作用。計算復雜性理論不僅反映密碼破譯的固有困難,評測密碼算法對抗密碼破譯的實際能力,還能為不同密碼算法實現難度的分析與比較提供了方法。   算法復雜 ...

Thu Sep 09 00:15:00 CST 2021 0 153
一次計算多個表型的遺傳相關性(LDSC, GCTA)

遺傳相關計算之前介紹過幾次了,感興趣的翻之前的推文: 1、利用GCTA工具計算復雜性狀/特征Complex Trait)的遺傳相關性genetic correlation) 2、LD SCore計算基因多效遺傳度、遺傳相關性 之前的兩篇推文均有一個小局限,就是針對多個表型間的遺傳 ...

Sat Oct 24 04:11:00 CST 2020 0 1091
(zz)計算復雜性:NP=P?

NP完全性理論的奠基人—1982年度圖靈獎得主斯蒂芬·庫克 ---- 加拿大多倫多大學教授斯蒂芬·庫克(Stephen Arthur Cook)因其在計算復雜性理論方面的突出貢獻,尤其是在奠定NP完全性理論基礎上的突出貢獻而榮獲1982年度的圖靈獎。但庫克實際上是美國科學家。 ----庫克 ...

Fri Jun 01 02:58:00 CST 2012 0 3474
數據特征相關性分析

分析連續變量之間的線性相關程度的強弱 相關性分析是指對兩個或多個具備相關性的變量元素進行分析,從而衡量兩個變量因素是相關密切程度。 1,圖示初判 2,Pearson相關系數(皮爾遜相關系數) 3,Sperman秩相關系數(斯皮爾曼相關系數) 1,圖示初判 (1)變量之間的線性相關性 ...

Mon Mar 09 17:18:00 CST 2020 0 1646
Kolmogorov復雜性

的不可計算 Kolmogorov復雜性的鏈式法則 壓縮 Chaitin的不完備 ...

Sat Jun 28 02:24:00 CST 2014 0 2852
軟件復雜性

http://student.zjzk.cn/course_ware/software/txt/txt/show.asp?filename=11_3.txt 11.3 軟件復雜性11.3.1 軟件復雜性的基本概念 軟件復雜性度量的參數很多,主要有: (1) 規模,即總共的指令數 ...

Sat Jun 18 08:05:00 CST 2016 0 1689
 
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