宏基因組測序: 濃度>=50ng/ul OD260/280:1.8-2.0 DNA兩次需要量>=3ug 宏基因組測序需要提供什么樣品要求? (1)提供環境微生物的基因組DNA或者擴增產物,OD值在1.8 ...
文章鏈接:http: biorxiv.org content early 作者:Yee VoanTeo,NicolaNeretti 時間: . . 摘要: 許多宏基因組分類工具在宏基因組學領域增長速度飛速。然而,在這個領域相近物種的分類仍然是一個挑戰。這里,我們用兩個宏基因組數據集,人類宏基因組數據和環境宏基因組數據對比MetaPhlAn , kallisto 和 Kraken的性能。研究表明ka ...
2016-11-20 11:26 0 1550 推薦指數:
宏基因組測序: 濃度>=50ng/ul OD260/280:1.8-2.0 DNA兩次需要量>=3ug 宏基因組測序需要提供什么樣品要求? (1)提供環境微生物的基因組DNA或者擴增產物,OD值在1.8 ...
描述 MetaPhlAn是分析從物種水平分辨率宏基因組鳥槍法測序數據的微生物群落(細菌,古細菌,真核細胞和病毒)的組成的計算工具。從版本2.0,MetaPhlAn還能夠確定具體的菌株(在將樣品含有先前測序的菌株的不那么頻繁的情況下),並跟蹤跨越樣品菌株的所有物種。 MetaPhlAn 2依靠 ...
動物基因組大小(需翻牆) 植物已測序的基因組大小 真菌基因組大小 原核生物基因組大小 5.NCBI怎么缺呢 注:若如,可要查近源種 ...
mVISTA可對2個或者多個DNA序列進行比較,可以對比對結果進行可視化。 詳情請大力戳這里 0 輸入文件說明 mVISTA 需要輸入的文件有如下幾類 必須文件 郵箱 fasta格式序列文件(或者GENBANK identifier) 上傳文件不得> 10 Mb ...
https://mp.weixin.qq.com/s/xsL9GuLs7b3nRF8VeRtinQ http://www.sohu.com/a/146620511_769248 宏基因組測序(MetagenomicsSequencing)是對環境樣品中全部微生物的總DNA(也稱宏基因組 ...
擴增子常見問題 01 實驗室檢測的DNA濃度很高,送到公司檢測之后濃度卻比較低呢? 1、老師在實驗室多采用Nanodrop對DNA濃度進行檢測 ...
1. 打開NCBI 2. 輸入物種名,以HPV為例: 搜索,到genomes分欄下面選擇Assembly點擊進去 3. 進去下面的界面,再點擊RefSeq進入下載界面 4. 進入下載界面: HPV參考基因組下載界面:https ...
基因組水平以及轉錄組水平研究技術 1/20/2016 0 Comments ...