基因組組裝流程
1. 前期准備 背景信息： GC含量 和 GC分布 基因組重復程度 基因組大小估計 雜合情況 最好的情況是對方能提供已經發表的近源物種。根據近源物種分析以上信息，尤其是GC含量以及對應的GC分布，重復程度。 2. 測序策略 根據基因組大小和具體情況選擇個大概的k值 ...
原文：基因組組裝算法
目前，構建Graph的主流方法有 種，Overlap Layout Consensus Celera Assembler PBcR ，de Bruijn Graph SOAPdenovo 和 String Graph Falcon 。 相關文獻 基於De Bruijn圖的宏基因組序列組裝算法研究 CNKI 對基因組組裝算法的分析和研究 CNKI 基於De Bruijn圖的De Novo序列組裝軟件 ...
2016-06-16 10:38 0 16483 推薦指數：
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基因組組裝項目的十二步建議
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