使用 PhyML 構建進化樹
1. PhyML 簡介 使用 PhyML 構建最大似然樹。參考文獻：New Algorithms and Methods to Estimate Maximum-Likelihood Phylogenies: Assessing the Performance of PhyML 3.0 ...
原文：使用RAxML做Maximum likelihood 進化樹
沒有授權禁止轉載 話說ML進化樹如果要進行高bootstrap值的驗證的話對於計算能力要求是很高的。不並行做基本不可能。 所以下了一個RAxML，在linux下有好幾種編譯方式，看了一下手上的機器支持AVX指令集，所以選擇AVX MPI方式吧。 先安裝openmpi，照網上教程編譯就行，就是略慢。 但是安裝完mpicc之后，再去編譯RAxML時發現gcc版本不夠高，無法支持AVX，雖然不知道AVX ...
2016-01-03 19:32 0 4650 推薦指數：
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