原文:MAFFT多重序列比對--(附比對彩標方法)

轉記 MAFFT多重序列比對圖解教程 絮語 一提到多重序列比對,很多人禁不住就想到ClustalW Clustalx為ClustalW的GUI版 ,其實有一款多重序列比對軟件 MAFFT,不論從比對速度 Muscle gt MAFFT gt ClustalW gt T Coffee ,還是比對准確性 MAFFT gt Muscle gt T Coffee gt ClustalW 來說,其相比於C ...

2015-06-21 13:34 0 16209 推薦指數:

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MAFFT 進行多序列比對

簡介 最經典和廣為熟知的多序列比對軟件是 clustalw 。 但是現有的多序列比對軟件較多,有文獻報道:比對速度(Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee),比對准確性(MAFFT>Muscle>T-Coffee> ...

Mon Dec 30 03:01:00 CST 2019 0 2962
多重序列比對 CLUSTALX

【實驗目的】 1、熟悉構建分子系統發生樹的基本過程,獲得使用不同建樹方法、建樹材料和建樹參數對建樹結果影響的正確認識; 2、掌握使用Clustalx進行序列多重比對的操作方法; 3、掌握使用Phylip軟件構建系統發生樹的操作方法。 【實驗原理】 在現代分子進化研究中,根據現有生物基因 ...

Sat Oct 19 05:15:00 CST 2013 0 4737
MSA:多重比對序列的格式及其應用

多重比對序列的格式及其應用 這里對多重序列比對格式(Multiple sequence alignment – MSA)進行總結。在做系統演化分析、序列功能分析、基因預測等,都需要涉及到多重序列比對。特別是當需要用不同軟件對多重比對序列進行批量操作時,會遇到各種的格式 ...

Thu Aug 28 02:15:00 CST 2014 0 2557
序列比對

文章轉載於 Original 2017-07-11 liuhui 生信百科 多序列比對(或多序列聯配,multiple sequence alignment,MSA),是指把多條(3 條或以上)有系統進化關系的蛋白質或核酸序列進行比對,盡可能地把相同的鹼基或氨基酸殘基排在同一 ...

Sun Jul 16 05:43:00 CST 2017 0 1903
序列比對&建樹

目錄 目標物種和序列 相關Seq列表 多序列比對的原理和方法 相關的工具 建樹的幾種方法 實際操作 Muscle&ClustalW 可視化 ...

Mon Apr 06 09:05:00 CST 2020 0 669
序列比對-muscle & trimal

2021年了,從零開始幾個字可以去掉了,做了很多次服務器搭建,其實能夠叫零的之前已經是講完了。 其實應該做一個總結,但是沒有時間,后面再說吧。 本文也沒有什么內容,因為很簡單: ...

Fri Jan 29 03:09:00 CST 2021 0 580
序列比對那點事兒

序列比對那點事兒 2012-04-17 ~ ADMIN 本來這應該是一本書,那樣的話的確需要花一點心思,就寫成一篇短文吧。 從字符比對開始說起吧。第一個問題最簡單,如何判斷兩個字符串是相等的。 int strcmp(const ...

Fri Oct 19 05:50:00 CST 2018 0 1405
Mega-序列比對

Aligning Sequences In this tutorial, we will show how to create a multiple sequence alignm ...

Thu Mar 05 21:09:00 CST 2020 0 2365
 
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