原文:搭建高性能計算環境(一)、Linux操作系統的安裝和配置

一般課題組剛開始做計算,往往沒有專門的集群,主要用自己的PC機 工作站或者買幾台服務器來跑跑 小伙伴們摸索Linux的使用 編譯一些開源軟件 甚至寫點Shell腳本需要耗費很多時間,耽擱了讀文獻 碼論文的進展。 在此寫幾篇Blog,將Linux系統的安裝 設置,常用軟件的安裝 編譯整理出來,分享給大家 內容只包含單節點的情況,不涉及集群 作業調度系統及跨節點計算 。 , 安裝CentOS . 。 ...

2014-11-13 09:32 1 2204 推薦指數:

查看詳情

搭建高性能計算環境(八)、應用軟件的安裝之gromacs

1,下載安裝新版本的gcc(高版本的gcc只是推薦使用的,系統自帶的gcc4.4照樣能正常編譯、運行) 安裝完成后設置環境變量(/etc/profile),需要重新登錄后才起作用。 2,下載安裝fftw 3,下載安裝cmake 安裝 ...

Fri Nov 21 18:55:00 CST 2014 0 2174
搭建高性能計算環境(二)、遠程登錄Linux服務器

一般操作Linux系統都是通過遠程登錄使用的,本節介紹幾種遠程登錄Linux、上傳下載文件的工具。 1、 Secure Shell SSH 簡單方便、既能使用命令行登陸也能傳文件,免費。 打開SSH Secure Shell Client程序就能打開軟件界面,點擊Quick ...

Thu Nov 13 18:42:00 CST 2014 0 2165
搭建高性能計算環境(三)、安裝intel編譯器和mpi

很多計算軟件都是要從源代碼編譯的,並且運行也需要mpi的支持,本節我們來安裝intel編譯器和openmpi。 1、 Intel編譯器的安裝 需要的軟件包:parallel_studio_xe_2013_update2_intel64.tgz、License文件 1)首先將軟件包 ...

Mon Nov 17 19:44:00 CST 2014 1 9015
搭建高性能計算環境(九)、應用軟件的安裝之gaussian 09

高斯軟件一般使用的都是編譯好的二進制版,所以解壓縮后設置一下環境變量就可以用了。 設置環境變量,添加到/etc/profile文件中,重新登錄后生效。 有一點需要注意: g09程序對訪問權限有要求,如果高斯程序的權限允許組外用戶訪問,則會提示如下錯誤 ...

Sat Nov 22 19:37:00 CST 2014 0 2812
怎樣安裝Linux操作系統

linux是免費的。其實這里的免費只是說linux的內核免費。在linux內核的基礎上而產生了眾多linux的版本。Linux的發行版說簡單點就是將Linux內核與應用軟件做一個打包。較知名的發行版有:Ubuntu、RedHat、CentOS、Debain、Fedora、SuSE、OpenSUSE ...

Thu Jan 25 07:07:00 CST 2018 0 12946
安裝linux操作系統

安裝Linux操作系統 1. red hat linux 版本 Red Hat企業版: Red Hat Enterprise Linux (簡稱RHEL);官網:http://www.redhat.com Fedora社區版:由Red Hat資助的社區維護,定位於個人桌面用;官 ...

Thu May 03 17:02:00 CST 2018 0 3542
 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM