首先QTL是數量性狀位點,比如身高是一個數量性狀,其對應的控制基因的位點就是一個數量性狀位點,而eQTL就是控制數量性狀表達位點,即能控制數量性狀基因(如身高基因)表達水平高低的那些基因的位點。 數量性狀基因座:控制數量性狀的基因在基因組中的位置稱數量性狀基因座。常利用DNA分子標記技術對這些區域 ...
首先QTL是數量性狀位點,比如身高是一個數量性狀,其對應的控制基因的位點就是一個數量性狀位點,而eQTL就是控制數量性狀表達位點,即能控制數量性狀基因 如身高基因 表達水平高低的那些基因的位點。 數量性狀基因座:控制數量性狀的基因在基因組中的位置稱數量性狀基因座。常利用DNA分子標記技術對這些區域進行定位,與連續變化的數量性狀表型有密切關系 表達數量性狀基因座 expression Quantit ...
2014-08-11 10:12 0 13375 推薦指數:
首先QTL是數量性狀位點,比如身高是一個數量性狀,其對應的控制基因的位點就是一個數量性狀位點,而eQTL就是控制數量性狀表達位點,即能控制數量性狀基因(如身高基因)表達水平高低的那些基因的位點。 數量性狀基因座:控制數量性狀的基因在基因組中的位置稱數量性狀基因座。常利用DNA分子標記技術對這些區域 ...
目錄 什么是eQTL?是通過哪些數據計算得來的,數據格式是什么? eQTL一般都富集在基因組的什么區域? 幾個常見的eQTL數據庫 什么是GTEx?目前第幾版了?GTEx里面有哪些數據? GTEx有哪幾篇里程碑文章? 大部分課題組是如何利用GTEx數據的? GTEx/eQTLGen ...
MatrixEQTL是一個快速有效的cis/trans eQTL mapping分析工具,被The Genotype-Tissue Expression (GTEx)數據庫用於eQTL mapping分析。使用MatrixEQTL進行eQTL mapping需要五個輸入文件,即SNP.txt ...
1、eQTL、mQTL共定位分析的作用 eQTL、mQTL共定位分析屬於Post-GWAS的一項重要工作,旨在GWAS結果的基礎上鑒定與表型相關的eQTL和mQTL位點。 傳統的GWAS是將全基因組范圍內的常見變異進行關聯分析,鑒定與表型相關的基因座,但鑒定出來的位點大多數位於基因間隔區 ...
到底什么是eQTL? eQTL和QTL之間有什么聯系?為什么說QTL比eQTL難很多? QTL和GWAS有什么關系? GTEx數據庫里的eQTL數據如何利用? 說eQTL之前必須先解釋QTL,QTL,一說到中文名就清楚了,數量性狀位點,就是一個性狀,比如身高,會由成百上千個基因來決定 ...
functional genomics | epigenomic annotations 剛入行的總是一頭霧水,對這些表觀的標記一點興趣都沒有,種類繁多,總是記不住,這里我就做一個常識性的總結,不搞 ...