甲基化分析中limma包中的logFC值是怎么來的
最近在做甲基化分析，看到logFC值，突然好奇這個值是怎么轉化過來的。 測試了一下，limma的logFC值與glm函數的Estimate值是一樣的。 以下是limma包的結果，可以看到 logFC值為-0.09222974： 以下是glm函數的結果： logFC值用公式來表示 ...
原文：limma包的使用技巧
limmar package是一個功能比較全的包，既含有cDNA芯片的RAW data輸入 前處理 歸一化 功能，同時也有差異化基因分析的 線性 算法 limma: Linear Models for Microarray Data ，特別是對於 多因素實驗 multifactor designed experiment 。limmar包的可擴展性非常強，單通道 one channel 或者雙通道 ...
2014-05-06 16:44 0 10505 推薦指數：
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