原文:多重序列比對 CLUSTALX

實驗目的 熟悉構建分子系統發生樹的基本過程,獲得使用不同建樹方法 建樹材料和建樹參數對建樹結果影響的正確認識 掌握使用Clustalx進行序列多重比對的操作方法 掌握使用Phylip軟件構建系統發生樹的操作方法。 實驗原理 在現代分子進化研究中,根據現有生物基因或物種多樣性來重建生物的進化史是一個非常重要的問題。一個可靠的系統發生的推斷,將揭示出有關生物進化過程的順序,有助於我們了解生物進化的歷 ...

2013-10-18 21:15 0 4737 推薦指數:

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MSA:多重比對序列的格式及其應用

多重比對序列的格式及其應用 這里對多重序列比對格式(Multiple sequence alignment – MSA)進行總結。在做系統演化分析、序列功能分析、基因預測等,都需要涉及到多重序列比對。特別是當需要用不同軟件對多重比對序列進行批量操作時,會遇到各種的格式 ...

Thu Aug 28 02:15:00 CST 2014 0 2557
MAFFT多重序列比對--(附比對彩標方法)

[轉記]MAFFT多重序列比對圖解教程 【絮語】   一提到多重序列比對,很多人禁不住就想到ClustalW(Clustalx為ClustalW的GUI版),其實有一款多重序列比對軟件-MAFFT,不論從比對速度(Muscle>MAFFT> ...

Sun Jun 21 21:34:00 CST 2015 0 16209
序列比對

文章轉載於 Original 2017-07-11 liuhui 生信百科 多序列比對(或多序列聯配,multiple sequence alignment,MSA),是指把多條(3 條或以上)有系統進化關系的蛋白質或核酸序列進行比對,盡可能地把相同的鹼基或氨基酸殘基排在同一 ...

Sun Jul 16 05:43:00 CST 2017 0 1903
Mega-序列比對

Aligning Sequences In this tutorial, we will show how to create a multiple sequence alignm ...

Thu Mar 05 21:09:00 CST 2020 0 2365
用blastall進行序列比對

用blastall進行序列比對 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常強大,其下面有非常多的參數,但是一般使用的參數如:-p、-i、-d、-o、-e等幾個。 -p: 執行的程序名稱 -d: 搜索的數據庫名稱 -i : 要查詢的序列文件名(Query File ...

Fri Mar 06 18:38:00 CST 2020 0 698
megacc的進行多序列比對

1.軟件的安裝: 網站:http://www.megasoftware.net/ windows上安裝,下載windows-command line(cc)版本的,格式為zip,解壓之后,里面有兩 ...

Fri Dec 22 03:59:00 CST 2017 0 1842
序列比對&建樹

目錄 目標物種和序列 相關Seq列表 多序列比對的原理和方法 相關的工具 建樹的幾種方法 實際操作 Muscle&ClustalW 可視化 ...

Mon Apr 06 09:05:00 CST 2020 0 669
序列比對-muscle & trimal

2021年了,從零開始幾個字可以去掉了,做了很多次服務器搭建,其實能夠叫零的之前已經是講完了。 其實應該做一個總結,但是沒有時間,后面再說吧。 本文也沒有什么內容,因為很簡單: ...

Fri Jan 29 03:09:00 CST 2021 0 580
 
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