PYMOL分子比對


兩種方式:

一,分子全局比對

1)導入第一個分子;

2)導入第二個分子;

3)選中第一個分子》A》align》to molecule》選中第二個分子

此時,會出現較多黃黃的線,難看死了;我猜全局比對只適合高度同源的分子;

 

二,分子局部比對

1)導入第一個分子;

2)導入第二個分子;

3)選擇第一個分子的比對氨基酸序列,並重新命名A;

4)選擇第二個分子的比對氨基酸序列,並重新命名B;

5)第一個分子的部分氨基酸序列對象A》A》align》to selection》第二個分子部分氨基酸序列對象B;

部分比對的示意圖如下

 


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