文件權限問題導致plink報錯 Failed to open 21JAN.log. Try changing the --out parameter.

本文轉載自查看原文 2022-01-23 23:45 1189 遺傳分析/ linux目錄權限/ plink/ plink linux Failed to open

晚上興起，想起一直以來沒有解決的問題，於是復制一個目錄，開始跑數據，但是跑到第一步就采坑

plink --chr-set 95 --file merge --mind 0.1 --geno 0.1 --maf 0.05 --chr 1-18 --recode --out 21JAN

報錯，（沒有復制全）

Failed to open 21JAN.log. Try changing the --out parameter.

找了半天原因，網上也沒找到，后來想起可能是權限問題，於是

sudo chmod -R 777 testyy

居然跑通了

把權限改到755 ，錯誤又變了

PLINK v1.90b6.22 64-bit (16 Apr 2021)          www.cog-genomics.org/plink/1.9/
(C) 2005-2021 Shaun Purcell, Christopher Chang   GNU General Public License v3
Logging to 21JAN.log.
Options in effect:
   --chr 1-18
   --chr-set 95
   --file merge
   --geno 0.1
   --maf 0.05
   --mind 0.1
   --out 21JAN
   --recode

31470 MB RAM detected; reserving 15735 MB for main workspace.

做個筆記

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