MageCK 分析sgRNA 篩選

#軟件安裝

1. 參考鏈接https://sourceforge.net/p/mageck/wiki/Home/  

本身打算按照conda install +package的方法，安裝，但是一直出現：

# Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.

2.采用原代碼文件安裝。

下載源代碼：https://sourceforge.net/projects/mageck/

 

需要下載到mageck-0.5.9.4.tar.gz文件。

# tar -zxvf mageck-0.5.9.6

進入文件夾找到setup.py #說明這是一個python寫的安裝包。

#python3 setup.py install.

即可

 

#操作實例

參考文章： https://hpc.nih.gov/apps/MAGeCK.html  

MAGECK2官方說明鏈接：https://sourceforge.net/p/mageck/wiki/Home/